研究人员挖掘数据并将点连接到驱动神经母细胞瘤的过程
10月14日,2020年)研究人员已经从神经母细胞瘤的综合基因组分析中使用了洞察,以了解驾驶最常见的儿童实体肿瘤之一的过程。该研究结果揭示了开发精密药物以改善患者结果的可能方法。圣裘德儿童研究医院科学家们带领这项研究,今天出现在日志中自然通信。
分析涉及全基因组,整个外壳和整个转录组702的分析成神经细胞瘤样品。肿瘤包括复发患者的23个样本。该工作确定了研究人员希望能够治疗的共同突变特征之间的关联。
“这种综合分析大型肿瘤的综合分析提供了洞察神经母细胞瘤工作中的先前未被识别的相关性,以及对常见驾驶员突变的发现,”圣·朱德省主席京辉张,博士说计算生物学。
共同作者是迈克尔戴尔,博士,博德,豪华院,霍华德休斯医学院调查员,Chilladelphia儿童医院Michael Hogarty M.D.。
将常见突变和氧化应激之间的点连接
研究人员使用了常见的突变模式,几乎像指纹,以识别加强肿瘤的生长和传播的内部过程。研究人员知道DNA损伤的分子称为反应性氧,并且氧化应激在神经母细胞瘤中升高。在细胞线粒体中产生反应性氧物质。该分析发现65%神经细胞组织和DNA损伤分子之间的染色体突变之间的关联。这些肿瘤具有额外的染色体17.该片包括在线粒体中表达的基因。结果表明,线粒体基因缺陷可能导致增加产量反应性氧气促进肿瘤生长和耐药性。
ST. jude云搜索39以下的1,000多个儿科肿瘤基因组癌症类型发现该协会并非唯一。研究人员报告说,来自另一种癌症的20%以上的样本横纹肌肉瘤,具有增加的线粒体基因的表达和增加的氧化应激的模式。该发现加强了线粒体基因缺陷与突变过程的新鉴定的联系。
“由于这种分析,我们对驾驶神经母细胞瘤的改变更深入了解,包括肿瘤的形式,进展和对治疗的响应方式,”达特表示。“这是翻译研究进展的基础。”
神经母细胞瘤预测器
神经母细胞瘤在胎儿神经细胞中发育,称为神经细胞通常通常成熟。虽然7至10%的儿童癌症是神经母细胞瘤,但肿瘤占婴儿中所有癌症的一半。这种癌症通常始于肾上腺,但它也可以从胸部,脊柱或脊髓区域,腹部和其他区域开始。
治疗和结果基于患者年龄的差异很大。最小患者(年龄小于18个月)的生存率约为95%。对于年龄较大的高风险患者,求生存率只有约50%。
本研究强化了患者年龄与促进疾病的突变之间的关联。例如,基因Mycn和Tert通常在3.8岁或以下患者中改变,而ATRX的突变在中位年龄为5.6岁的儿童中更频繁。
mycn,atrx和“美丽的融合”
分析提供了对戴尔及其同事的先前研究的洞察力。研究人员指出,虽然Mycn或Atrx是神经母细胞瘤的有效驱动因素,但突变并未一起发生。
“在大多数癌症中,您希望发现两个突变患者甚至更糟糕的患者,”戴尔说。“但我们从未找到这种组合,这是一个惊喜。”
戴尔表示,这种分析表明为什么。MyCN和ATRX突变诱导氧化应激。染料假设,当组合时,突变可能是致命的瘤细胞。
“这是一种美好的两种不同方法,以了解细胞内部的突变过程,”他说。
经常出现,但较少的基因改变分析包括圣·耶和华的数据,包括圣裘德华盛顿大学儿科癌症基因组项目;治疗上适用的研究,以产生由国家癌症研究所管理的有效治疗(目标)倡议;和儿童肿瘤组,临床合作试验组。
大量样品的援助努力寻找重复性,但不太常见的神经母细胞瘤改变,可用于精密药物的候选物。新发现的突变在FGFR1和ALK中。
进一步探索
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