早期COVID-19病例在南加州与纽约
大多数COVID-19(冠状病毒)的患者在南加州的最初几个月大流行期间似乎已经感染的一种变体SARS-CoV-2病毒引入该地区从纽约州通过欧洲,不直接从中国,首次检测到病毒,根据一项新的研究在cedars - sinai进行。
研究结果是基于遗传分析中发现的病毒组织样本从192例诊断为COVID-19在cedars - sinai。
调查人员说,他们认为他们的研究是第一个发表SARS-CoV-2的遗传特征在洛杉矶人口使用先进的技术被称为下一代测序,分析所有的基因,或病毒的基因组,或其他器官。该研究发表在《华尔街日报》10月7日《美国医学会杂志》网络开放。
“基于这些发现,我们的结论是SARS-CoV-2可能引入洛杉矶社区主要来自纽约州,也通过多种其他独立传播途径,包括华盛顿州和中国,”Eric维尔说,医学博士,主任助理教授和分子病理学系的病理学和实验室医学在cedars - sinai。他是这项研究的文章的第二作者。
具体地说,调查人员发现,约15%的病毒样本取自COVID-19病人在cedars - sinai 3月22日至4月15日发布概要文件的基因相似的SARS-CoV-2病毒从亚洲,而82%的共享与变异密切的相似之处源于欧洲。
“这是令人惊讶的,纽约似乎如此多的洛杉矶病毒的来源,尤其是在美国第一次确认COVID-19例涉及一个人回到华盛顿州访问中国后,“茉莉花普卢默说,博士,研究员西奈生物信息学中心副主任和功能基因组学和应用基因组学、计算和转化的核心。她研究的其他文章的第二作者。
此外,SARS-CoV-2的分析病毒使用新一代测序证明是如此精确,调查人员能够识别一个独特的集群13冠状病毒患者,所有成员相同的宗教教派,生活半径2.4英里内的对方。这一发现指出,潜在的使用这种技术来监视当地社区传播的疾病。
“这创新研究比较遗传分析提供数据推动SARS-CoV-2独有的识别功能,”医学博士David Frishberg说主席学术病理学和病理学和实验室在cedars - sinai医学教授。“测序发现COVID-19提供关键信息和它的起源与进化,他们甚至可能有助于预测其未来的轨迹。”