基因组研究揭示了下丘脑在炎症性肠病中的作用

基因
信用:CC0公共领域

使用复杂的3-D基因组映射和与基因组关联研究(GWAS)的公共数据集成,费城(Chec)儿童医院的研究人员发现炎症性肠病(IBD)和压力和抑郁症之间的显着遗传相关性。研究人员继续涉及涉及富含衍生的下丘脑神经元的IBD风险的新基因,这是一种巨大的大脑,在控制压力和抑郁方面具有重要作用,以及来自结肠细胞的有机体,更常见的区域在IBD的背景下。

调查结果发表在细胞和分子胃肠病学和肝病学

“我们的结果对丘博的遗传易感性致力于丘脑遗传态度的作用,”Choc和Daniel B. Burke赋予糖尿病队的副主席的董事研究。“流行病学数据先前在IBD和IBD之间显示重叠和抑郁症,现在我们生成了基因组学数据来支持该协会。我们的研究结果表明,下丘脑担保人在IBD发病机制的背景下进一步研究。“

包括克罗恩病(CD)和溃疡性结肠炎(UC)的IBD主要是一种免疫介导的病症,其特征在于胃肠道的失调炎症。疾病课程从长期活跃到间歇或罕见的耀斑。已知多种遗传和环境因素有助于IBD的发病机制,包括通过GWAS分析报告的疾病的230多个基因座。许多人中很多居住在这些基因座上涉及与免疫系统和微生物组有关的途径。

然而,还有越来越多的证据表明,IBD临床关联与压力和抑郁症。鉴于下丘脑在压力反应中的作用以及抑郁症的发病机制,研究人员决定探讨下丘脑在IBD中的遗传作用。

首先,研究人员在IBD和抑郁症之间进行了遗传相关分析,以评估使用公开的数据的两个条件之间的遗传平分性程度。研究团队使用抑郁症作为压力的代理,因为有限数量的GWAS努力集中在一致的压力定义上,而相比之下,抑郁症的遗传学已经相对较高,导致了一个大,相对均匀的身体工作的。

研究人员发现IBD与抑郁症相关的11种自身免疫疾病是与抑郁症的最具统计学显着的特征,尽管哮喘和多发性硬化也是高度相关性的。

然后,研究小组进一步进行了分析,以验证IBD和IBD之间的相关性。首先,它们测量了丘脑状神经元(HNS)内的3-D基因组模式中的IBD相关遗传变异的富集,以及来自直肠活组织检查的结核,发现HNS的高度显着的四倍增加和七倍增加较为熟知的上衣设置。然后,研究人员使用了一种精致的“变体对基因映射”方法,该方法设计成碎片,以确定哪些基因涉及在这些富集的信号中IBD的发病机制。然后,评估那些涉及基因,研究人员寻找可能受到IBD相关遗传变异的途径。

通过这种变体对基因的测绘努力,研究人员将25个基因赋予HNS中的25个基因赋予IBD的风险。这些基因的11人在大脑中具有已知的功能,特别是Crem,CNTF和RhOA,其是编码应力的关键调节器的基因。这些基因中的七种也涉及中性。在途径方面,除了在免疫和微生物组信号传导途径中预期的富集外,研究人员还观察到荷尔蒙信号通路的整体富集。

“我们建议一些IBD相关的变体改变下丘脑 - 垂体 - 肾上腺轴和应力反应,这可能反过来在易于促进这种疾病的患者中发挥作用,并加剧其呈现,”格兰特说。“未来的研究是有必要改进我们对IBD发作中下丘脑的作用的理解。”


进一步探索

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更多信息:Chiara Lasconi等,变体对基因映射分析揭示了下丘脑在炎症性肠病遗传易感性中的作用,细胞和分子胃肠病学和肝病学(2020)。DOI:10.1016 / J.JCMGH.2020.10.004
由...提供费城儿童医院
引文:基因组研究揭示了炎炎症疾病中下丘脑(2020年10月29日)从HTTPS://MedicalXPRESS的炎症疾病(2020年10月29日)的作用,从https://medicallexpress.com/news/2020-10-genomic -reveals-roly-hypothalamus-inflammatory.html
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