'多OMIC'为免疫家庭树添加新细胞
威世研究人员使用了强大的“单细胞多OMICS”技术来发现先前未知的T和B淋巴细胞的祖先,这是我们免疫系统的关键组成部分。
使用类似类似的方法将体育队的表现归结为个别球员统计数据,研究人员研究了单一开发免疫细胞的多个方面,以确定哪些细胞只会产生T和B淋巴细胞。这揭示了一个新的阶段淋巴细胞发育,可以丰富免疫系统研究的信息。该发现还导致了新的研究机会,威仕于2018年建立了澳大利亚首批专用和集成的单细胞研究平台之一,目前正在用于解决其他研究问题。
研究,发表在自然免疫学今天,由Shalin Naik博士,Daniela Zalcenstein博士,Luyi Tian先生,Jaring Schreuder先生和Sara Tomei先生。
聚焦在单细胞上
我们的免疫系统包括许多不同类型的细胞,具有不同的功能,但所有免疫细胞源自单一类型的细胞,血液干细胞。不同免疫细胞类型的发展通过未成熟细胞的分支'家族树'进行。在早期的免疫细胞发育的阶段,个体细胞可以产生几种不同类型的成熟细胞,而是随着显影的进展,细胞变得更加限制,其中它们可以产生最终成熟细胞。
纳克博士说,T和B淋巴细胞对靶向的特异性免疫应答 - 是密切相关的免疫细胞,这意味着它们在其发展中分享了许多常见步骤。“几十年的研究已经确定了当显影细胞失去发展到其他免疫细胞类型的能力时,他们在家族树中产生了T和B淋巴细胞的发展和”分支点“,”他说。
Zalcenstein博士表示,为了提高免疫细胞如何发展的问题,该团队建立了澳大利亚的第一个“单细胞多OMICS”平台,现在可以为单个细胞开放研究努力(得分)内的所有研究人员提供由Naik博士和Zalcenstein博士与韦里的基因组学枢纽博士和副教授Matthew Ritchie副教授合作。
“多OMICS技术将不同的生物数据集合 - 例如基因组学,转录组织和蛋白质组学 - 以通过查看一个数据集来比较不同的样本比可以更详细地进行比较。我们已经应用了这种方法来研究个体细胞,在这种情况下发展免疫细胞,更详细地理解哪种细胞可以产生淋巴细胞。这种方法称为单细胞多OMIC,“她说。
“而不是看一些样本中的许多细胞的数据,我们专注于个别细胞,了解更大人群中存在的差异。就像看足球队一样 - 你可以平均出来的目标数量,铲球每位球员在一场比赛中踢,但如果你看看个人统计数据,你可能会发现一个球员得分很多目标,而另一名球员对大多数铲球负责,“她说。
一种新的淋巴细胞祖细胞
分数对免疫细胞前体的研究显示出一种以前未被识别的细胞类型,可以产生T和B淋巴细胞,但不是其他免疫细胞。
“这种细胞在淋巴细胞发展方面发生得比我们怀疑的淋巴细胞发展更早,”Naik博士说。“以前的技术将不同的免疫祖细胞分组在一起,但通过研究各个细胞,我们能够鉴定一种致力于发展成为T和B淋巴细胞的一种细胞类型。”
该发现将新层添加到T和B淋巴细胞的家谱中,并可以提高其他研究领域。
“更详细地理解T和B淋巴细胞的发展可能导致更好的方法来重新生成这些细胞“奈克博士说,”我们还说,“我们还知道许多类型的白血病因免疫细胞开发的早期阶段的缺陷而产生,所以我们很想知道这个祖细胞是否与任何形式的白血病有联系。“
Zalcenstein博士表示,该研究是单细胞多OMICS的力量的重要示例。“淋巴细胞发展已经过分研究了至少四十年。即便如此,通过应用这种新方法,我们能够了解更多信息。这是第一个被得分处理的项目之一,从那以后我们已经应用了相同的方法是超过100种不同的研究问题。这是一个真正令人兴奋的新领域,成为一部分,“她说。
进一步探索
用户评论