精确定位给冠状病毒的“沉默”突变是一种进化边缘
我们知道Covid-19危机背后的冠状病毒在蝙蝠和其他野生动物中生活无害,然后跳到了物种障碍并溢出到人类。
现在,Duke大学的研究人员在病毒的大约30,000个字母中发现了许多“沉默”突变遗传密码这让它茁壮成长,一旦它使飞跃和可能帮助为全球大流行的阶段设定了阶段。微妙的变化涉及病毒如何将其RNA分子折叠在人细胞内。
在第10月16日发表的研究中peerj.,研究人员使用统计方法他们开发出鉴定人类中SARS-COV-2基因组中出现的适应性变化,但不在蝙蝠和穿山甲虫中发现的密切相关的冠状虫病毒。
“我们试图弄清楚这项病毒如此独一无二的是什么,”在Duke的生物学家Greg Wray的实验室的博士后助理博士助理博士助理。
以前的研究检测到在编码冠状病毒表面的“穗”蛋白的基因内检测到阳性选择的指纹,这在感染新细胞的能力中起着关键作用。
新的研究同样标记的突变改变了穗蛋白,表明携带这些突变的病毒菌株更可能茁壮成长。但通过他们的方法,研究作者Berrio,Wray和Duke Ph.D.学生Valerie Gartner还确定了以前的研究未能检测到的额外罪魁祸首。
研究人员报告说,在SARS-COV-2基因组的其他两个区域中所谓的沉默突变,被称为NSP4和NSP16,似乎已经给予先前菌株的生物边缘,而不改变它们编码的蛋白质。
Berro表示,而不是影响蛋白质,而不是影响病毒的遗传物质如何影响,这是如何由RNA折叠成3d形状和人细胞功能。
Berroi0说,RNA结构的这些变化可能已经完成了将SARS-CoV-2病毒设置为仍然不为人知的人。但他们可能为病毒传播的能力造成了促进的能力,因为人们甚至知道他们有它 - 这一重要差异,使目前情况更难以控制于2003年的SARS Coronavirus爆发。
Berro说,该研究可能导致新的分子靶点治疗或预防Covid-19。
“NSP4和NSP16是第一RNA分子中产生时的第一个RNA分子之一病毒感染新人,“Berio说。”飙升蛋白质直到以后没有表达。所以他们可以做出更好的治疗目标,因为它们在病毒生命周期早些时候出现。“
更一般地说,通过针对使新冠状病毒茁壮成长的遗传变化,科学家希望在发生之前更好地预测未来的动物质疾病爆发。
“病毒不断变异和发展,”Berro说。“所以,有可能感染其他动物的冠状病毒的新菌株也可能伴随着延伸给人们,就像SARS-COV-2一样。我们需要能够识别并努力早期包含它。“
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