研究团队识别良性和致病基因变异之间的差异
由Cleveland Clinic的Lerner Research Institute领导的国际研究人员首次进行了来自1,330个疾病相关基因的密码变异的广泛表征。出版于国家科学院的诉讼程序,该研究识别与致病和良性变体相关的特征,揭示突变在分子水平下的影响。
“我们的研究是为个人诊断和精确药物翻译个人基因组学的强大资源,可以帮助变体解释,告知实验并帮助加速个性化药物发现,“Dennis Lal,Ph.D.,助理人员,基因组医学和研究的铅作者说。重复大规模的DNA测序努力检测到数百万的麦基义变异,DNA代码中的错误改变氨基酸(分子建筑蛋白质的蛋白质的构成蛋白质。一些这些变体是致病性的,这意味着它们以导致疾病的方式改变蛋白质的结构和功能,而另一些则对健康产生影响。然而,绝大多数,被认为是不确定意义的变体,因为它们的效果仍然未知。
虽然存在预测变异致病性的方法存在,但它们并不阐明为什么某些变体或多或少可能导致疾病或建立其功能影响。此外,致病和良性变体几乎可以在几乎每种疾病相关基因中都存在。因此,获得更好地理解良性和致病变体之间的机械差异将是开发遗传障碍新疗法的关键下一步。
考虑到蛋白质的功能与其三维结构密切相关,在这项研究中,研究团队鉴定并比较了蛋白质特征氨基酸受致病的影响与良性错过变种。与良性变体(3-D突变热点)相比,在致病变体中更常见的特征可能是至关重要的蛋白质健身,因此可以帮助解释致病性的分子决定因素。
看1,330个病情相关的病情基因研究人员分析了一组40个特征,发现18与致病变体显着相关,14与良性变体显着相关,其余8与任何变体类型无明显关联。
“通过考虑遗传变异在蛋白质的三维组织的背景下,我们首次出现了致病性突变的分子特性的图表,该突变的分子特性解决了良性和疾病引起的突变之间的差异,“Lal表示。”本研究重点关注1,330个与之相关的基因罕见的遗传疾病类型,因此我们目前正在扩展我们的项目来查看更多的基因和较温和的障碍。“来自该研究的数据(包括预先计算的P3DFIDAGS1330和P3DFipRoteinclass值,用于每种可能的蛋白质中的蛋白质中的所有可能的氨基酸交换,随着索引的理由的改变站点的3-D特征的显式列出,可通过专用的Web服务器分析提供。
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