洛杉矶儿童医院进行最大的儿科基因组Covid-19迄今为止的研究
涉及孩子们,很明显,Covid-19影响它们的影响超过最初意识到。然而,关于SARS-COV-2的信息相对较少,病毒在儿科群体中导致疾病的病毒。儿童医院洛杉矶的科学家刚刚发布了最大的儿科Covid-19研究迄今为止,建议首次进行特定病毒突变与疾病的严重程度之间的可能链接。
Covid-19不是遗传疾病,但SARS-COV-2病毒的遗传在其蔓延中起着重要作用。突变 - 病毒基因组中的错误,因为它重复 - 可以影响病毒的发射方式,并且可能在疾病严重程度中发挥作用。了解这些链接对于争夺这种大流行来说至关重要。
“SARS-COV-2是遗传上不稳定的,”儿童医院洛杉矶生物信息学总监Xiaowu Gai博士说。“我们倾向于提到”病毒“,但是当我们考虑病毒基因组时,它不是静态,单一病毒,但真正收集受感染患者内所有病毒的遗传变化。”
根据盖博士的说法,大多数突变均为SARS-COV-2病毒经历或甚至可以削弱它。然而,一些突变可以改变大流行的过程。例如,称为D614G的突变在所谓的病毒的尖峰蛋白质中可能有助于从人到人的方式增加传播性。在大流行的开始时,D614G突变占SARS-COV-2样品的一小部分,但它增加了这么多,即这种版本的病毒已经接管。
现在,盖博士说,几乎每个他们序列都有这个突变的样本。“我们不知道的是这种突变和其他突变是否会影响疾病在患者身上的严重程度,”他说。“这就是我们想要了解的东西。”为好理性 - 如果医生可以预测哪些患者更容易具有严重疾病,则可以迅速给予救生处理。
但是很少基因研究发布,何时了解病毒如何影响儿童,数据甚至更薄。“真的有缺乏SARS-COV-2的儿科基因组研究,”詹妮弗迪恩·贝加斯,博士,儿童医院洛杉矶临床微生物学和病毒学实验室主任。“我们正在努力改变这个。”
博士。GAI和DIEN BARD在病理学和实验室医学系的多学科团队中致力于遗传序列,他们接受的每一个Covid-19阳性样品,将CHLA放在儿科病毒基因组研究的最前沿。他们的努力导致了迄今为止SARS-COV-2发布的最大临床相关的儿科基因组数据。除了测序样本之外,科学家正在调查病毒的子组(称为片状)的子组如何影响儿童。
“这项研究非常独特,”Dien Bard博士说,“除了拥有这个大量的基因组数据外,我们还是真的看它所意味着什么:我们如何追踪这种病毒?基因组学如何相关有临床结果?这些研究刚刚在那里才能出现,所以我们试图填补这种需求。“
研究中出现的一个趋势是某一组突变,称为Clade 20C,在患者中更常见于患有最严重的Covid-19症状。本研究是第一个检查这些潜在链接的研究。
“需要更大的研究证实,确认SARS-COV-2的一个亚组导致更糟糕的预后,”GAI博士说,“但本研究是一个明确的例子,突出了检查遗传学的重要性病毒。这些是难题碎片,这将有助于我们超越这种大流行。“
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