所有癌症中的三分之一的新遗传脆弱性
癌症突变往往能够致力于重要的基因,迫使肿瘤依赖于其他基因的存活。这种遗传依赖性是对新癌症治疗的有吸引力的目标。
在发表的一项研究中细胞报告,来自癌症依赖地图(Depmap)的科学家在广泛的麻省理工学院和哈佛大学和哈佛大学和达纳 - 前癌症研究所和同事们报告了遗传依赖性,可能存在于所有癌症中最多的三分之一。在这些癌症中,研究人员发现,两个相关的一个基因,VPS4A和VPS4B被禁用,导致肿瘤依赖于其他基因进行存活。旨在关闭其他基因的药物可能会杀死这些癌症。
在他们的学习中,团队使用了大规模的Crisp-and RNA干扰(RNAi),基于873的屏幕癌细胞系从超过2种形式的癌症,专注于称为肿瘤抑制剂的基因已被删除或关闭的癌症。这些基因通常会防止受损细胞从不断增长的未经选中。
“肿瘤抑制剂难以治疗,”Depmap团队的研究科学家和巨大的癌症计划和Dana-Farber,以及与博士后的贾斯珀登轮的研究的联合第一作者,Chrenton Paolella表示。“但我们意识到我们有机会通过寻找与肿瘤抑制损失相关的其他基因来找到新的目标。”
研究人员在检查患有两个肿瘤抑制基因中的一种的细胞系之后,对vps4a和vps4b转化为vps4a和vps4b,该肿瘤抑制基因中的一个,cdh1和smad4,常见于癌症。他们发现vps4a通常与cdh1一起删除,Cdh1坐在染色体16上。它们还在vps4b与smad4之间发现了类似的关系,占据了染色体18上的相同邻域。
有趣的是,研究团队指出,代表各种癌症的细胞系依赖于两种VPS4基因的一种,包括儿科横纹肌肉瘤和胆管,膀胱,乳腺癌,结直肠癌,食管,胃,肝,肺,卵巢,和胰腺癌。总共,表示大约三分之一的癌症的细胞系覆盖了VPS4A或B依赖性。为了确认,它们从癌症基因组Atlas查询数据,在该项目中收集的所有癌症中的33%的癌症中发现VSP4B损失,额外的27%。
vps4a和vps4b是普拉戈尔科 - 分子兄弟双胞胎,这些双胞胎来自共同的遗传祖先,分享类似的任务。两种分子机的编码部分称为ESCRT复合物(有助于保持细胞内和周围的膜的完整性)。
由Jungers,Paolella,Depmap分析主任和研究所科学家Francisca Vazquez的研究团队领导,以及宽阔的和Dana-Farber的副会员Andrew Aguirere - 进一步探讨了一个VSP4基因的丧失会使癌细胞依赖于另一个。实际上,在多种细胞和动物模型中,他们发现缺乏Smad4和Vsp4b的癌细胞易受vps4a破坏的影响。
“这是权力的另一个伟大的例子癌症依赖图Vazquez说,持有难以分析肿瘤的分子信息难以确定的目标。“
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