研究发现,多人群风险评分可以改善炎症性肠病的风险预测
西奈山研究人员利用来自近3万人的遗传数据,建立了代表不同祖先人群的组合数据集的风险评分,提高了炎症性肠病(IBD)的风险预测,包括克罗恩病和溃疡性结肠炎。这项研究发表在胃肠病学12月24日。
研究人员发现,利用西奈山多种族生物群落生物样本库中多个种群的关联数据建立的多基因风险评分,最大限度地提高了每个种群的IBD预测人口在“生物银行”。BioMe是一个系统的努力,在西奈山,是革命性的诊断和疾病分类根据患者的分子简介。研究表明风险得分计算从集成数据显著提高预测个体与欧洲,德系犹太人,和西班牙裔祖先在生物群落,以及欧洲人在英国生物库,其中包含生物和医学数据在40 - 69岁之间的一百万人生活在英国。非洲血统患者的预测能力较低,可能是由于参考数据集非常小,而参考数据集非常大遗传多样性在非洲人后裔的人群中。
“准确预测不同祖先个体的遗传疾病风险的能力是一个关键途径,可能对患者的预后产生积极影响,如早期干预,甚至预防措施正在考虑和发展,”该研究的高级作者朱迪H. Cho说,医学博士,翻译遗传学院长和查尔斯布朗夫曼研究所个性化医学在西奈山伊坎医学院的主任。“这些发现支持需要更多的遗传多样性,包括更多关于非裔美国人的数据,以提高疾病风险预测,减少所有人群的健康差异。”
这些多基因风险评分代表了基于个体众多,最常见的遗传变异的总和的总体风险的估计,使用来自欧洲、非裔美国人和德系犹太人背景队列的IBD关联数据进行计算。此外,研究人员评估了每个人群中与非常早发性IBD相关基因的罕见变异,发现携带罕见LRBA变异的非裔美国人LRBA和CTLA-4蛋白的表达均降低。LRBA缺乏增加了对IBD的易感性,导致低CTLA-4表达,这可以用常用的抗疟药物氯喹逆转。Cho实验室未来的研究将集中于预测哪些亚群的患者可能受益于靶向该通路。
“由于降低LRBA和CTLA-4的表达可以导致IBD,氯喹能够部分恢复表达是令人鼓舞的,”该研究的第一作者凯尔·盖特勒博士说,他是西奈山伊坎医学院遗传和基因组科学系的博士后研究员。
发表:2020年12月24日,doi:doi.org/10.1053/j.gastro.2020.12.034
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