在拉丁美洲人中，美洲原住民祖先与更多的EGFR基因突变相关

在拉丁美洲的肺癌患者中，基因组和祖先分析显示，美洲原住民祖先与EGFR基因突变增加相关，与吸烟无关癌症发现，中国癌症研究协会杂志。

“肺癌是美国和全球癌症死亡率的主要原因，并且遗传的理解风险因素对于这种疾病，可能有助于我们识别将受益于增加的筛查努力中受益的人群，“波士顿达纳 - 巴士癌症研究所癌症基因组学中心的主任Matthew Meyerson。

“以前的工作表明EGFR-突变体肺癌与北美和欧洲的肺癌患者相比，东亚的肺癌患者更常见，肺癌患者的比例分别为50%和10%。”她也是Dana-Farber癌症研究所和哈佛医学院的遗传学和医学教授，也是麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的成员。他补充说:“但尚不清楚egfr突变肺癌的种族差异是由于环境因素还是遗传因素。”

Meyerson及其同事分析了来自拉丁美洲的1,153名肺癌患者的样品。其中，601名来自墨西哥，552名来自哥伦比亚，499名患者作为非吸烟者自我报告。通过肿瘤样本的基因组分析，研究人员鉴定了EGFR，KRA和其他靶基因的体细胞突变。

利用Jian Carrot-Zhang博士和Alexander Gusev博士开发的新方法，研究人员还对这一混合人群的肿瘤样本进行了祖先分析。进行了全球祖先分析，以衡量非洲、欧洲和美洲原住民的祖先在整个基因组中的比例。此外，进行了当地祖先分析，评估遗传祖先在一个特定的染色体位置。Meyerson解释说，由于当地祖先只评估基因组的一小部分，观察到的关联被环境暴露或社会经济状况混淆的可能性较小，而这可能在全球祖先分析中看到。

利用基因组和祖先数据，研究人员评估了体细胞突变在单一混合人群中的目标基因和全球祖先组。经过各种因素的调整，包括自我报告吸烟情况和样品特异性肿瘤突变负担，研究人员发现，全球原住民祖先与EGFR基因中的突变呈正相关。此外，研究人员发现，美国原住民祖先主要与EGFR基因中的致癌突变相关，但不具有非致癌突变。

Meyerson和他的同事们随后根据患者自我报告的吸烟状况对他们进行了分层，并评估了全球血统和基因突变之间的关系目标基因。无论从不吸烟者还是吸烟者，全球印第安人祖先都与EGFR基因突变相关，这表明与印第安人祖先相关的基因组差异与吸烟状况无关。

“吸烟会增加KRAS-突变体肺癌的风险，而肺癌患者患有非吸烟者的患者更常常发展EGFR-突变体肺癌，”Meyerson说。“然而，我们在我们的研究中展示了EGFR-突变体肺癌在拥有美洲原住民血统的吸烟者中也升高。”

研究人员接下来开发了一个当地美洲原住民祖先风险评分，以评估祖先与基因组中多个不同位点的EGFR突变频率的协会。他们发现，EGFR基因中的祖先与突变频率之间的相关性比全球基因组水平更强。“这些结果表明，种系遗传学 - 除了环境因素或社会经济地位之外 - 可能对拥有美洲原住民血统的EGFR-突变体肺癌风险的影响，”梅尔森说。

“许多肺癌目前都可以治疗有针对性的治疗或免疫疗法，”梅耶森继续说道。“对肺癌患者进行体细胞遗传检测至关重要，以确定哪些治疗最有可能对其特定癌症有效。”

该研究由Meyerson共同领导;由Gusev是Dana-Farber和哈佛医学院的助理医学教授;Clinica del Country的Andres F. Cardona，MD，哥伦比亚波哥大临床和应用癌症研究（FICMAC）;由奥斯卡阿·奥斯塔·阿斯蒂塔，MD，在墨西哥城的Instituto Nacional de Cancerologia的胸部肿瘤学士。Carrot-Zhang是Dana-Farber癌症研究所和广泛研究所的博士后研究员，以及该研究的第一作者，用Gusev开发了计算方法，并进行了大部分计算分析。

该研究的局限性包括小样本大小，梅伊森注意到鉴定细菌或种系中的鉴定，这些基因或位点与含有原住民的美国国内外EGFR突变有关祖先。此外，研究人员仅测试了已知的热点突变和蛋白截断肺癌驾驶员基因中的突变突变，​​并且需要将来的工作全面表征肺癌症Meyerson说。

该研究得到了V基金会斯图尔特斯科特纪念基金和国家癌症研究所的翻译研究奖。Meyerson是一位美国癌症学会研究教授。

Meyerson是起始的科学咨询委员会主席，并获得了诊断的Labcorp的专利的发明者突变对于EGFR基因，在EGFR抑制剂上申请专利申请。Meyerson从拜耳，詹森，诺沃企业和奥诺制药有限公司获得研究资金

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