基因定位冠军冰岛在冠状病毒测序方面领先
冰岛在大流行开始以来的所有阳性Covid-19案件中,这是一个越来越重要的做法,因为令人担忧的新菌株从英国和南非出现。
周五世界卫生组织敦促所有国家加快基因组测序,以帮助打击新兴变体。
冰岛生物野蛮的科学家解码雷克雅未克的实验室在过去的10个月内致力于努力,分析每个阳性新冠病毒应国家的要求在冰岛进行测试卫生当局。
目的是追踪每种情况,以防止有问题的是滑过网的。
“我们花相对较短的时间来做实际的测序,”实验室负责人Olafur Thor Magnusson解释说,并补充说“大约3个小时”就是确定病毒株所需的全部。
整个过程,从将DNA分离到测序它,最多可能需要一天半,并使冰岛能够识别463个单独的变体 - 科学家称之为单倍型。
在测序之前,首先分离每个样品的DNA,然后使用磁珠纯化。
然后,样本被带到一个巨大而明亮的房间,里面摆满了设备,类似扫描仪的小机器发出震耳欲聋的声音。
该机器是映射新型冠状病毒基因组的基因序列。
世界领导者
每台机器内部都有一个被称为“流动细胞”的黑盒子,这是一个载有DNA分子的玻璃片。
自大流行开始以来,这项技术在冰岛发挥了重要作用。
“样本的排序是帮助我们遵循流行病的国家和发展的关键,”卫生部长Svandis Svavarsdottir告诉法新社。
她说,有关部门已经利用测序信息来决定精确、有针对性的措施,以遏制病毒的传播。
虽然冰岛未在冰岛检测到南非别人,但41人被确定为英国变体的载体。
所有这些都在边境停止 - 在旅行者上进行PCR测试,有效地防止了亚曲率岛上的变体的传动。
DNA识别还使得可以在9月中期的雷克雅未克中部和新浪风中的大多数感染之间建立一个明确的联系,该浪潮领先的当局在首都关闭酒吧和夜总会。
测序还确定了来自两个法国游客的单独菌株,他们在抵达冰岛测试积极的游客,并且初步被指控 - 误认为是9月激增的原因。
冰岛报告的大约6,000个Covid-19案件中所有的所有案例都被测序,使其成为Covid测序的世界领导者。
虽然英国、丹麦、澳大利亚和新西兰等一些国家进行了高水平的测序,但没有一个国家能达到冰岛的水平,尽管全球统计数据尚不完整。
孩子的戏剧
那么,冰岛为何如此遥遥领先呢?
基因映射是解码的专业。
该公司成立于1996年,进行了有史以来规模最大的人群基因研究。
在2015年一项有关癌症风险因素的研究中,该机构对2500名冰岛人的整个基因组进行了测序,并研究了当时33万冰岛人口中三分之一的基因图谱。
与此相比,测序Covid-19样本是儿童的戏剧。
“序列是非常容易序列这种病毒基因组:它只是30,000个核苷酸,它没有,”Quips Kari Stefansson,这家71岁的创始人和首席执行官。
相比之下,在他的实验室中通常分析的人类基因组包含34亿对核苷酸或有机分子,他补充道。
虽然冰岛的严格测序对于跟踪病毒的传播有用,但它尚未导致任何用于解码的主要科学发现。
“如果病毒与各种模式突变的病毒之间存在差异,它们并不是很明显。我们对我们来说不够明显,”Stefansson说。
©2021法新社
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