关于疟疾基因组的开放数据将有助于打击耐药性

来自28个疟疾流行国家的7000多种疟疾寄生虫的基因组变异数据于今天发布惠康开放研究。它是由Malariagen制作的，是世界各地的数据共享网络，他们共同努力为疟疾研究和疾病控制构建高质量的数据资源。

此开放数据发布代表了世界上最大的基因组数据资源疟疾寄生虫进化和耐药性。它提供了在寻找新药物和疫苗中所需的寄生虫基因组变异的基准数据，以及在疟疾控制和消除的监测工具的开发中。

疟疾是一个主要的全球健康问题，2019年造成估计409,000人死亡，其中67%的死亡发生在5岁以下儿童。这一数据来源侧重于恶性疟原虫，这种疟疾寄生虫是最常见和最致命的疾病的罪魁祸首。

疟疾基因组流行病学网络(MalariaGEN)为疟疾流行国家的研究人员和控制规划提供了基因组分析的DNA测序技术和工具。MalariaGEN成立于2005年，目前在39个国家有合作伙伴，每个国家都领导着自己的研究，研究疟疾生物学和流行病学的不同方面共同的目标找到改善疟疾控制的方法。

这份最新的出版物代表了在非洲、亚洲、南美和大洋洲73个地点的49项伙伴研究的工作，他们共提供了7113个恶性疟原虫样本用于基因组测序。在维康桑格研究所，每个样本都被分析了超过300万种基因变异，这些数据被精心整理，然后再返回给合作伙伴用于他们自己的研究。本文汇集了来自所有合作伙伴研究的数据，为更广泛的科学界提供了一个开放的数据资源。

Richard Pearson博士来自Wellcome Sanger Institute的联合作用者说：“我们创建了一个数据资源，这些资源是任何用于任何人的人，包括没有专业遗传学培训的数据资源。每个注释的数据集样本都包含关键功能与疟疾控制相关，如耐药性患有六种主要的抗疟药药物，以及它是否携带特定的结构变化，导致疟疾测试失败。与人类基因组项目一样是对人类基因组序列数据分析的资源，我们希望这将是是疟疾研究的主要资源之一。“

疟疾的核心原则之一是提供明确的归因和认可，这些组有助于数据资源。在这个数据集中，每个样本都列在其所属的合作伙伴研究中，并描述了研究的科学目标和引领工作的当地调查人员。

来自牛津大学维康桑格研究所和大数据研究所的合著者Dominic Kwiatkowski教授说:“与我们在世界各地的MalariaGEN合作伙伴合作建立这个数据资源是一种巨大的荣幸。我们很自豪地看到这些基因组数据被我们的疟疾流行研究同事和疟疾研究界的其他人在出版物中使用。我们希望这个数据发布的新功能能让更广泛的用户可以访问它，我们的团队现在正在努力制作下一个版本。”

Mali科学大学教授Abdoulaye Djimde教授表示：“对疟疾寄生虫如何对公共卫生干预措施的定量评估是成功和可持续消除活动的关键。随着时间的推移，这公开可用的资源将促进研究疟疾寄生虫的进化过程，最终会通知有效和可持续的疟疾控制和消除策略将成为结束这种破坏性疾病的关键。“

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