在非洲裔美国人民IBD的第一次多全基因组研究

在非洲裔美国人,根据IBD在非洲裔美国人的第一个全基因组研究的结果,炎症肠道疾病(IBD)的遗传风险景观与欧洲祖先的人们不同。作者称,未来对IBD的临床研究需要考虑祖先。

这项多中心研究分析了1700多名克罗恩病和溃疡性结肠炎患者和1600多名对照组患者的全基因组,研究结果发表在2月17日的美国《柳叶刀》杂志上美国人类遗传学杂志

作为分析的一部分,研究人员开发了一种在计算IBD时纠正祖先的算法。多基因风险评分是计算疾病基因风险的工具,用于IBD和其他复杂的疾病,如冠状动脉疾病。

“尽管疾病目的地看起来也是如此,但在特定基因对IBD的风险有助于风险的方面,人口看起来非常不同,”罗布拉斯坦,MD。“它表明,您无法基于一个人的人口发展多基因风险分数,并将其应用于另一个人口。”

Kugathasan是小儿炎症性肠病项目的科学主任,亚特兰大儿童保健中心儿童移植和免疫介导疾病中心主任,同时也是埃默里大学医学院儿科和人类遗传学马库斯教授。ob体育开户网址

本文的第一个作者是遗传学家Hari Somineni,博士,他赢得了博伊里的博士与Kugathasan一起工​​作,现在正在马萨诸塞州的Goldfinch Bio工作。

招聘学习参与者的主要场地是埃默里,Cedars-Sinai和Rutgers,以及圣路易斯的约翰霍普金斯和华盛顿大学。除了kugathasan之外,该研究的共同高级作者和共同组织者是Steven Brant,MD来自Rutgers和Dermot McGovern,MD,Ph.D.来自Cedars-Sinai。

“我们治疗IBD的目标之一是走向一种更个性化的方法,”McGovern说,他是cedar - sinai炎症性肠病遗传学的Joshua L.和Lisa Z. Greer主席。“破译基因结构是这项工作的重要组成部分。这样的研究对于确保包括非裔美国人在内的不同人群从基因组医学承诺的巨大进步中受益至关重要。”

有一级亲属患有IBD的风险比任何已知的环境因素都大。传统上认为非裔美国人患IBD的风险较小,但是Kugathasan说,这种观点可能反映了在诊断和获得医疗保健方面的差异。

kugathasan说,该研究表明,非洲裔美国人 - 普尔人民的IBD中IBD的最重要遗传风险基因座在欧洲祖先人群中相对较小。相比之下,两种基因位点在欧洲人 - Nod2和IL23R - 在非洲裔美国人中发挥较小的作用。

由于非洲裔美国人历史上大约有20%的欧洲遗传背景,与已知的IBD危险因素(如IL23R)来自欧洲方面,遗传风险因素有一些重叠。

2016年,研究团队发表了对非洲裔美国人民IBD的第一个基因组协会研究,鉴定了与之相关的基因组的区域只对非洲人后裔有效。

Kugathasan说,未来的IBD治疗临床研究需要考虑到特定人群的遗传背景。几种针对IL23受体通路的IBD治疗方法正在开发中,部分原因是IL23R是一个主要的遗传风险因子,而很少关注PTGER4。他说,这种情况需要改变。

目前的研究也证实了这一点授权对非洲裔美国人特有的IBD风险,在以前的研究中尚未观察到。该变体连接到编码Calbindin 2(CALB2)的基因,涉及神经系统信号传导的蛋白质。

研究没有发现研究人员的研究 - 是一系列罕见的遗传变异,解释了非洲裔美国人中IBD中的“失去遗传性”。在基因组 - 范围内的协会研究中,遗失的遗传性是指常见基因变异不占疾病风险。

对于IBD领域的未来,Kugathasan表示,基因环境相互作用的研究 - 饮食,微生物组或有毒暴露等因素 - 可能会产生洞察力,即基因组 - 宽的协会研究没有。


进一步探索

基因组研究确定非裔美国人患炎症性肠病的风险基因

更多信息:Hari K. Somineni等人,非裔美国人全基因组测序表明炎症性肠病的遗传结构差异,美国人类遗传学杂志(2021)。DOI:10.1016 / J.AJHG.2021.02.001
由...提供埃默里大学
引用:首次非洲裔美国人IBD的多全基因组研究(2021年2月19日)于2021年4月18日从//www.puressens.com/news/2021-02-multi-whole-genome-ibd-african-americans.html获得
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