美国赶紧赶上比赛来检测突变病毒
![Clinical lab scientist Selam Bihon processes upper respiratory samples from patients suspected of having COVID-19 at the Stanford Clinical Virology Laboratory on Wednesday, Feb. 3, 2021, in Palo Alto, Calif. Viruses mutate constantly. To stay ahead of the threat, scientists analyze samples for genetic changes, watching closely for ones that might make the virus more infectious or more deadly. (AP Photo/Noah Berger) 美国赶紧赶上比赛来检测突变病毒](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2021/usrushestoca.jpg)
尽管其世界级的医疗系统及其致命的疾病控制和预防中心,但美国在比赛中落后于检测危险的冠状病毒突变。它现在才开始赶上来。
问题缺乏技术或专业知识。相反,科学家们说,它没有国家领导和协调,加上缺乏融资的资金和供应,试图用狩猎进行遗传变化搏斗诊断测试。
“我们有头脑。我们有工具。我们有这些工具,”加州大学尔湾分校病毒研究中心主任伊尔赫姆·梅萨迪(Ilhem messoudi)说。“这只是支持这种努力的问题。”
病毒不断变异。为了赶在威胁之前,科学家们分析样本,密切关注可能使冠状病毒更具传染性或更致命的突变。
但这种测试已经散发出来。
在美国,只有不到1%的阳性样本正在进行测序,以确定它们是否存在令人担忧的突变。其他国家在这方面做得更好——英国在10%左右——这意味着他们可以更快地看到即将到来的威胁。这给了他们更大的机会来减缓或阻止这一问题,无论是通过更有针对性的接触追踪、可能的疫苗调整,还是公开警告。
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CDC官员称,Variants在整个美国案件中没有驱动最近的潮流。但专家们担心变体发生的事情并不清楚,并说国家应该更加积极地对流行病的排序,现在已经造成了超过45万名美国人。
“如果我们有证据表明它正在改变,”俄亥俄州立大学的分子生物学家丹·琼斯(Dan Jones)说,“也许人们会采取不同的行动。”
美国科学家已经发现了500多例首次在英国发现的变异病例,预计这种变异将在几周内成为英国大多数新感染病例的病因。上周,美国也发现了与巴西有关的另一种令人不安的变异,以及在南非发现的第三种变异,预计也将蔓延。
英国变种更具传染性,被认为比原来更致命,而南非人可能会使疫苗有所效益。最终担心的是,对现有疫苗和治疗的变异可以最终出现。
可能令人担忧的版本也可能在美国内部形成。“这种病毒是突变的,它不关心它在爱达荷州或南非,”Messaoudi说。
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但由于排序水平相对较低,美国的这一问题的真正规模尚不清楚。
“你只看到了灯柱下的内容,”明尼苏达大学基因组学中心主任Kenny Beckman说,该中心的总监开始于去年春天分析病毒的遗传学。
在开始缓慢之后,至少33个州的公共卫生实验室现在正在进行遗传分析以识别出现的冠状病毒变异。其他州与大学或私人实验室组成了合作伙伴关系。据公共卫生实验室协会称,北达科他在上周开始排序的是最近的工作,这是最近开始的工作。
CDC认为,应在美国每周分析5,000至10,000个样本。为了充分监测变体,他表示,Gregory Armstrong表示,他监督了该机构的先进分子检测工作。他才刚刚击中这一级别,才会击中这一级别。
尽管如此,这是一种混乱的方法:一些公共卫生实验室序列每种阳性病毒标本。一些专注于某些爆发或某些患者的样本。其他人随机选择样品进行分析。
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最重要的是,实验室在获得用于基因测序和诊断测试的所需物资(如移液管头和化学品)方面仍然存在困难。
乔·拜登(Joe Biden)总统从特朗普政府继承了这个机构,他提出了一项1.9万亿美元的COVID-19救援计划,呼吁增加用于病毒测序的联邦支出,不过具体金额尚未公布,其他细节也尚未制定出来。
“我们在基因组测序领域位居世界第43位。完全不可接受,”白宫冠状病毒应对协调员杰夫·齐恩茨说。
五年以上,美国公共卫生实验室一直在建立他们进行基因组排序的能力,这在很大程度上在粮食中毒爆发的来源方面致力于联邦推动零。
大流行一开始,一些实验室就开始对冠状病毒进行测序。例如,明尼苏达州卫生部(Minnesota Department of Health)实验室助理主任维特尔(Sara Vetter)说,该部门在3月份发现首例COVID-19病例后的几周内就开始这么做了。“这让我们领先了一步,”她说。
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美国疾病控制与预防中心同样与某些州合作,在4月份对近500个样本进行了测序,在5月和6月对1000多个样本进行了测序。
但是,许多实验室没有做同样的事情 - 特别是那些负担过度升高的冠状病毒诊断测试。CDC的Armstrong表示,当时,他无法证明在已经掌握了完全的手中并且没有任何证据进行了这种分析,他无法证明实验室可以做更多的排序。
“直到一个月前,它还不在紧急需要的事情清单上。西雅图弗雷德·哈金森癌症研究中心的科学家特雷弗·贝德福德说。“毫无疑问,联邦政府没有分配足够的资源来做这件事。”
与此同时,由于在爆发期间施加的留在家庭订单,一些实验室的研究人员被告知不去上班,Messaoudi说。
“而不是打电话,”她说:“他们送到家里。”
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2021年2月3日,周三,加州帕洛阿尔托,斯坦福临床病毒学实验室的一名实验室科学家正在处理COVID-19疑似患者的上呼吸道样本。病毒不断变异。为了在威胁面前保持领先,科学家们分析样本的基因变化,密切关注可能使病毒更具传染性或更致命的基因变化。(美联社照片/诺亚Berger) -
2021年2月3日,周三,加州帕洛阿尔托,斯坦福临床病毒学实验室,Marilyn Mar(右)和郑耐华(右)在处理疑似COVID-19患者的上呼吸道样本。病毒不断变异。为了在威胁面前保持领先,科学家们分析样本的基因变化,密切关注可能使病毒更具传染性或更致命的基因变化。(美联社照片/诺亚Berger)
虽然,夏天,一群科学家响起了警报美国基因组监测的现状,并开始推动更系统化的研究。
11月,CDC开始推出国家计划,以更具有条理地拉动和检查标本,以更好地确定循环的株。然后,在12月,美国有一个叫醒的电话,当英国研究人员宣布他们发现了一个似乎更容易传播的变种。
CDC通过宣布其监督计划的反应将扩大到每周全国自犯750个样本。该机构还与三家公司 - Labcorp,Quest Diagnostics和Illumina进行签约,每周均为数千个。国家实验室正在做成千上万的人。
与此同时,几乎可以肯定的是,疫情正在播下更多COVID-19突变的种子。
“在它有自由的地位的地方,斯克里普斯研究所科学家埃里克·托普博士说,这将是发展的重要变体。“更具基因组测序,我们可以在病毒前后越多。”
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