古代DNA揭示了结核病如何塑造人类免疫系统的线索

COVID-19只是对人类生活造成巨大影响的最新一种传染病。一项利用远古人类DNA的新研究揭示了在过去2000年里结核病是如何影响欧洲人的，特别是这种疾病对人类基因组的影响。这项工作，出版于3月4日美国人遗传学杂志，对研究不仅具有进化遗传学的影响，还具有如何影响免疫系统的遗传。

“当今的人类是那些在许多东西 - 气候变化和大流行病中幸存下来的人的后代，包括黑死病，西班牙流感和结核病，”在法国的研究所巴斯特·巴斯特研究室的高级作者Lluis Quintana-Murci说。“这项工作使用人口遗传学来解剖如何自然选择采取了我们的基因组。“

这项研究聚焦于TYK2基因的一个变种，称为P1104A，该基因的第一作者加斯帕德·肯纳(Gaspard Kerner)此前发现它与一种增加风险当变异是纯合子时，感染结核分枝杆菌后患病。(TYK2通过影响干扰素信号通路参与免疫功能。)肯纳，一个在读博士遗传疾病在普通的巴黎大学研究所，开始与Quintana-Murci，进化基因组学专家合作，研究进化和自然选择的人结核病遗传决定因素。

研究人员利用超过1000个欧洲远古人类基因组的大型数据集，发现P1104A基因的变异最早出现在3万多年前。进一步的分析显示，大约在2000年前，也就是当今传染性结核分枝杆菌菌株流行的时候，这种变异的频率急剧下降。该变异与其他感染性细菌或病毒无关。

Kerner说:“如果你的基因组中携带了这种变异的两个副本，而你遇到了结核分枝杆菌，你就很有可能生病。”“在青铜器时代，这种变异更为频繁，但我们发现，它开始被消极选择，这与结核病开始在欧洲流行有关。”

“这项工作的美丽是我们正在使用人口遗传学方法来重建流行病的历史，”Quintana-Murci解释道。“我们可以使用这些方法试图了解哪些免疫基因变异在过去10,000年中最多的增加，表明它们是最有益的，并且由于负面选择而下降最多。”

他补充说，这种类型的研究可以补充其他类型的免疫学研究，如那些在实验室进行的研究。此外，两位研究人员表示，这些工具可以用来研究多种传染病的许多不同基因变异的历史和影响。

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