B.1.1.7在美国迅速传播的COVID-19变种:研究

的faster-spreading B.1.1.7变体SARS-CoV-2第一次发现在英国,导致COVID-19的冠状病毒,很快地成为占主导地位的变种的病毒在美国,据一项研究来自斯克里普斯研究所的科学家和COVID-19测试机螺旋。

今天出现的调查结果细胞，建议未来的COVID-19病例数字和死亡率在美国的发病率会比在其他情况下要高。分析表明，在越来越多的SARS-CoV-2样本中检测到的这种变异，比以前占主导地位的SARS-CoV-2谱系的传播能力高出40- 50%。其他研究已发现证据表明，B.1.1.7变体导致致命COVID-19的可能性可能高出约50%。

"B.1.1.7 rapidly became the dominant SARS-CoV-2 variant in the U.K. and other countries after its emergence late last year, and the U.S. is now on a similar trajectory," says study co-senior author Kristian Andersen, Ph.D., a professor in the Department of Immunology and Microbiology at Scripps Research and director of Infectious Disease Genomics at the Scripps Research Translational Research Institute. "We need immediate and decisive action to minimize COVID-19 morbidity and mortality."

除Andersen外，另一位资深作者是William Lee博士，他是Helix的科学副总裁，该公司为美国各地的组织提供基于pcr的COVID-19检测。这项研究也由尼科尔·华盛顿博士(Helix研究副主任)和安德森实验室的卡蒂克·甘瓦拉普(Karthik Gangavarapu)撰写。

“B.1.1.7倍增率略有一周，传输速度增加40-50％，这意味着它可能对公共卫生有意义，”李说。“我们将继续监测这种和其他新出现的变种的传播至关重要，但我们目前的监督水平不足，落后于其他国家。我们需要更全面的国家SARS-COV-2基因组学监测计划来解决这。”

B.1.1.7型变异去年在英格兰南部出现，此后成为英国的主要变异。去年12月，安达信在斯克里普斯研究中心的团队与加州大学圣地亚哥分校的同事们证实了加州存在这种变异的首个证据。

一种支配模式

B.1.1.7变异包含几个突变，包括几个编码病毒刺突蛋白的基因。这些突变增加了刺突与人类细胞上ACE2受体结合的能力。虽然没有证据表明B.1.1.7变种可以逃避COVID-19疫苗，公共卫生官员们担心，这种病毒相对较高的传播速度将使疫情在疫苗能够结束之前严重恶化。

标准拭子测试新冠病毒检查病毒基因组上三个位点的独特基因序列;由于B.1.1.7的突变，其中两个位点呈阳性，但第三个位点呈阴性，这是在病毒的刺突基因内。

自2020年7月以来，对大约50万份Helix测试结果的新分析显示，这种三分之二模式，即所谓的s基因靶失败，或SGTF，在10月中旬以较低的频率(0.2%)持续明显。到2月的第三周，它已经上升到10.6%的频率，并且在美国25个州和地区的患者中被检测到。

这种SGTF模式也可能发生在其他具有突峰基因突变的SARS-CoV-2变种中，但研究人员通过对他们从12月到2月的每个SGTF样本进行测序发现，在986个样本中有662个(67%)含有B.1.1.7变种。这表明，拭子试验中的SGTF模式可以提供B.1.1.7流行率的快速粗略指标。

Variant进入这个国家很多次

分析还表明，自去年12月以来，B.1.1.7在SGTF结果中所占比例迅速上升——例如，到1月中旬，加州达到了约95%。除了通过SGTF方法检测到的659例B.1.1.7型病例外，研究人员还在加利福尼亚州非偏倚SARS-CoV-2基因组监测工作收集的样本中发现了另外3例B.1.1.7型病例。

该研究中测序的662例B.1.1.7病例来自美国10个州的样本，不过研究人员指出，覆盖美国33个州和地区的其他检测实验室到目前为止已经向CDC报告了至少一例B.1.1.7病例。

研究人员对检测到的B.1.1.7序列进行的家族树型分析显示，该变异至少从2020年11月下旬以来已多次被引入美国，尤其是在加利福尼亚州和佛罗里达州，而且在旅行增加的时期，包括感恩节这一周。

科学家们还发现，整体上，该变体似乎比以前主导的SARS-COV-2的变体速度迅速蔓延到40-50％。他们估计，在2月2021年2月，B.1.1.7的第一周约为美国的Covid-19案件的4.3％，包括加州4.2％的案件和佛罗里达州的11.5％的病例。

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