单细胞测序开辟了从源头根除白血病的新途径

今天发表在《科学》杂志上的一项研究描述了一种新方法自然通讯有可能推动国际研究努力，找到从源头根除癌症的药物。

大多数癌组织包括快速分裂细胞由于自我更新能力有限，这意味着大部分细胞在一定数量的分裂后停止繁殖。然而，癌症干细胞可以无限复制，促进癌症的长期生长和复发。

无法接受化疗等常规治疗的癌症干细胞是患者最初进入缓解期但很快复发的原因之一。急性髓系白血病是血癌的一种，复发的高概率意味着只有不到15%的老年患者活过5年。

然而，由于癌症干细胞的丰度低且与其他干细胞相似，因此很难分离和研究，阻碍了国际上开发针对靶点的精确治疗方法的努力恶性肿瘤细胞而不是健康的。

来自基因组调控中心(CRG)和欧洲分子生物学实验室(EMBL)的研究人员通过创造MutaSeq克服了这个问题，MutaSeq是一种可以用来区分癌症干细胞、成熟癌细胞和其他健康细胞的方法干细胞基于遗传学和基因表达。

“RNA为人类健康提供了重要信息。例如，对冠状病毒的PCR检测可以检测其RNA来诊断COVID-19。随后的测序可以确定病毒的变异，”Lars Velten解释，CRG的小组领导和论文的作者。“MutaSeq的工作原理类似于冠状病毒的PCR测试，但其水平要复杂得多，而且是以单个细胞为起始材料。”

为了确定单个细胞是否是干细胞，研究人员使用Mutaseq同时测量数千个RNA。然后发现细胞是癌症或健康的，研究人员进行了额外的测序并寻找突变。由此产生的数据有助于研究人员跟踪茎细胞癌症或健康，并帮助确定了什么癌症干细胞不同。

“有大量的小分子药物有了临床安全,但决定哪些癌症,更具体地说,这些药物的患者非常适合是一个艰巨的任务,”拉斯斯坦梅茨说,斯坦福大学教授,在海德堡欧洲细胞生物学实验室里的组长,该论文的作者之一。“我们的方法可以识别可能没有在正确的环境中测试过的药物靶点。这些测试需要在对照临床研究中进行，但知道要尝试什么是重要的第一步。”

该方法是基于单个细胞测序是一种越来越普遍的技术，它帮助研究人员从数千个单个细胞中收集和解释全基因组信息。单细胞测序为复杂组织和癌症提供了非常详细的分子图谱，为研究开辟了新的途径。

在解释他们的下一步计划时，Lars Velten说:“我们现在已经召集了来自德国和西班牙的临床研究人员，将这种方法应用于更大规模的临床研究。我们也使这个方法更加精简。我们的愿景是识别癌症干细胞特异性药物以个性化的方式靶向，最终使患者和医生在检测冠状病毒时更容易寻找这些治疗方法。”

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