研究人员为与癫痫和自闭症相关的基因提供完整的临床景观

费城儿童医院的研究人员（CHPO）隶属于Chop癫痫神经源性倡议（Engin）已经编制了400多种与SCN2A相关疾病的完全遗传和临床分析，这与各种神经发育障碍有关，包括癫痫和自闭症。通过将临床特征与标准化的格式联系起来，研究人员希望他们的发现能够改善鉴定和临床干预。

该研究在线在线公布药物的遗传学。

SCN2A基因中的致病变体可导致各种临床特征 - 或表型相关神经发育障碍。几项研究描述了在该基因造成疾病的变化的个体上收集的遗传信息。但是，虽然遗传信息以标准化的方式收集，对表型的数据不标准化，并且在本研究之前，这些患者的临床特征的可用数据尚未彻底分析，这意味着这些患者的基因型与表型之间的相关性往往是轶事的许多相关性。

为了适当地链接遗传和表型数据，来自ChecCh的研究人员使用人类表型本体（HPO），一种标准化患者的临床特征的方法，并允许数据转换为类似于遗传数据。

“基于我们以前的HPO工作，我们知道我们有机会为研究和临床社区提供SCN2A相关的完整表型景观讨厌，“英戈·赫尔比格，MD，参加了学习的理论和数据科学核心的医师和数据科学核心主任”。“SCN2A变种的个体具有各种各样的临床特征，其中一些难以承受在我们的研究之前轻松分类。“

研究人员从近二十年出版的SCN2A相关疾病中提取了与SCN2A相关疾病的表型信息，包括2001年至2019年间医学文献中的每种描述，除了患者之后是ENGIN。在413个无关的个人中，该研究团队在HPO条款中派生了10,860个临床注释，共有562个术语独特。这使得研究人员将临床特征与特定的遗传变异联系起来。

例如，蛋白截断变体，其是缩短基因编码序列的遗传变体与自闭症和行为异常有关。导致不同氨基酸的遗传密码的密码变异或改变遗传密码的产生比通常预期的氨基酸的产生与新生儿发病癫痫和癫痫发作有关。用一个主要成分分析为了简化数据的复杂性，研究人员发现，三个主要成分占其数据集中的表型变异性的三分之一，强调尽管数据的复杂性，但可以衍生出信息临床组。

“SCN2A相关的疾病是对可计算表型的这种系统映射的条件组。我们的研究结果有助于在SCN2A相关疾病中定义可能为未来精确药物方法铺平道路以帮助这些个人的疾病，”Helbig说。“这项工作建立在我们以前的研究之上，现在提供了一个框架，即HPO术语如何在各种罕见疾病中映射复杂的临床数据，以应对我们尚未存在的临床特征，自然历史和结果。”

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