小儿癌症有独特的遗传弱点

大多数针对特定基因突变的癌症药物是针对成人癌症而不是儿童癌症设计的，部分原因是儿童癌症的突变较少。为了寻找更多治疗儿童癌症的方法，麻省理工学院(Broad Institute of MIT)和哈佛大学(Harvard)、丹娜-法伯癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute)和波士顿儿童医院(Boston Children’s Hospital)的研究人员决定寻找各种儿童癌症的遗传依赖关系。这些依赖基因是癌细胞赖以生长和生存的关键基因，也是新疗法的希望目标。

来自癌症依赖地图（Depmap）项目的科学家及其同事已经确定了新的遗传依赖性儿科癌症，包括许多独特的这些类型癌症。他们的研究发表在自然遗传学，是遗传依赖性在儿科和成人癌症之间的差异的第一个综合思考。

在儿童癌症中发现的独特依赖性为这些癌症的药物开发提供了新的途径，其中一些癌症是用几十年前的药物治疗的。作者说考虑到成年人和童年癌症,再利用成人癌症毒品对儿童来说是不够的。

“从临床角度来看，我们的问题之一是，虽然少数儿童从匹配的靶向治疗中受益，但我们在成人癌症中看到的匹配率不一样，”金伯利·施特格迈尔(Kimberly Stegmaier)说，他是Broad研究所癌症项目的成员和儿科肿瘤学家，也是波士顿儿童医院和Dana-Farber癌症研究所的儿童血液恶性肿瘤项目的联合主任。“我们觉得绘制小儿癌症的遗传依赖关系的努力非常重要，因为我们需要为这些癌症识别新的靶点。”

“该项目一直是儿科肿瘤社区的一个很好的例子，共同与癌症依赖地图团队和广泛的遗传扰动平台合作，以便毫无疑问地成为该领域的新基础。我非常有信心这一点努力将在未来几年内继续呈现水果，“托德·戈尔布，纸张，副院校，广泛的董事。

数据可以通过depmap门户网站，该研究团队希望这张依赖图对制药公司和儿科肿瘤学研究人员来说是一个有用的资源。

童年挑战

儿童癌症是新的精密药物开发的具有挑战性的区域，而不仅仅是因为这些癌症中的突变数量相对较少，而且因为这些突变往往是编码难以靶向药物的蛋白质的基因。

“但我们知道可能存在许多与突变相关的遗传依赖性，并且仅通过测序的基因组来发现癌症细胞DepMap在Broad的科学主任弗朗西斯卡·巴斯克斯(Francisca Vazquez)说。“所以我们采取了不同的方法。儿童癌症模型在癌症依赖图。为了改变这一点，我们从商业和学术来源中获取了儿童细胞系，并创建了迄今为止最大的集合，”巴斯克斯说。

在他们的研究中，科学家们使用了在82个小儿癌细胞系上基于大规模的CRISPR型筛网，代表了13种固体肿瘤和脑癌，以鉴定细胞生长和存活所需的基因。该团队发现儿科癌症与成人癌症的遗传依赖性相似。此外，只有大约64％的遗传依赖性均为癌症类型常见。

Stegmaier说:“我们需要专注于一些药物目标，至少根据这些数据，这些药物相对来说是针对儿科的。”ob体育开户网址

结果中的结果和她的同事发现最令人兴奋的是依赖于一种癌症的依赖性。例如，该团队将称为TRIM8的基因确定为遗传依赖性，以味道患者的遗传依赖性，治愈率仍然徘徊在20％至30％。

“当你发现一个基因如Trim8，具有在特定儿科癌症内具有非常强烈的依赖性​​时，它非常令人兴奋。人们可以预测治疗靶向该基因的治疗窗口是高治疗窗口，因为没有其他癌症模型都没有“依赖于它，”斯特格马尔说。

团队努力

STEGMAIER和Vazquez补充说，儿科癌症的这一第一代依赖图的彻底性是对小儿疾病，CRISPR筛查，计算生物学和项目管理的专业知识的大规模合作。

“大规模项目和小儿疾病调查人员的癌症依赖地图团队的专业是项目成功的基础，”Vazquez说。

“作为儿科肿瘤科学家和计算生物学家，在这个项目上工作是特别有益的。我们治疗的许多儿童癌症患者没有有效的有效的靶向精确药物选择，因为这些选项主要针对成人癌症，我们的研究开始了揭示令人兴奋，新的儿科癌症的进一步研究机会，“本文首次作者和圣泰尔实验室的博士后学者，德国·达利亚表示。

Vazquez，Stegmaier和他们的同事现在计划扩大地图，包括更多类型的儿科癌细胞模型 - 包括脑​​癌和罕见的白血病，在实验室中可以更具技术上挑战研究。

该团队还将继续研究更多生物洞察力。“因为我们正在挖掘数据并观察不仅仅是一个单独的基因依赖性，而是同一网络中的多个，我们开始真正建立联系，”斯特格耶斯尔说。“数据允许您了解儿科癌症的基本机制。”

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