全基因组测序使更精确的诊断成为可能

由于将大规模基因组学技术整合到斯德哥尔摩地区的医疗保健系统中，1200多名罕见病患者得到了诊断。这是根据瑞典卡罗林斯卡医学院的一项研究得出的结论，该研究分析了卡罗林斯卡大学医院和sciilifelab在全基因组测序方面前5年合作的结果。这项工作，发表在基因组医学，构成了精准医疗新兴领域的一个重大飞跃。

“我们已经建立了一种工作方式，医院和大学合作，对每个患者的整个测序基因组为了找到不同疾病的遗传解释，”该论文的第一作者、卡罗林斯卡学院分子医学和外科学系的研究员亨里克·斯特拉内海姆说。“这是一个例子，说明了如何使用精准医学进行诊断，并针对个别患者定制治疗方案。”

大规模的全基因组测序技术，即确定一个人的整套遗传物质的过程，在近十年来取得了迅速的进展。尽管如此，世界上很少有诊所经常使用它来诊断病人。

就在5年前，卡罗林斯卡大学实验室和科学实验室的临床基因组学设施成立了卡罗林斯卡罕见病基因组医学中心(GMCK-RD)，其中包括来自卡罗林斯卡研究所和瑞典皇家理工学院的研究人员。

该中心在前5年对3219名患者进行了基因组测序，其中1287名患者(40%)得到了分子诊断罕见疾病．研究结果发表在现已发表的论文中。

研究人员在750多个基因中发现了致病性突变，并发现了17个新基因疾病基因。在某些情况下，这些发现为诸如遗传性代谢性疾病、罕见癫痫和原发性免疫缺陷的患者提供了个性化治疗。

“临床全基因组测序对罕见病领域有着巨大的影响，”卡罗林斯卡学院分子医学和外科学系的Anna Wedell教授说，她也是这篇论文的通讯作者之一。“如果使用方法正确，针对每个患者的具体临床情况，新的患者群体可以以一种以前不可能的方式得到正确的诊断和治疗。”

整体的主要挑战之一基因组测序就是管理和解释存在于每个人身上的数百万个基因变异。因此，该中心开发了一个模型，将最初的分析导向被认为与每个患者临床症状相关的致病基因变异。这意味着医生在决定应该首先进行哪些基因分析方面起着重要的作用。

如果第一次评估不能产生结果，分析将扩大到更多的基因面板，直到诊断可以建立和/或整个基因组测序。这一过程也使一些以前未知的疾病基因得以识别，为深入探索致病机制提供了新的机会。

目前正在开展一项重大工作，在瑞典保健部门更广泛的领域实施类似的工作方法。例如，卡罗林斯卡研究所和卡罗林斯卡大学医院最近成立了一个精准医疗联合中心(PMCK)，将巩固和扩大精准医疗方面的合作。

“对我们来说，精确地取得成功医学这篇论文的第二通讯作者安娜·林德斯特兰德说，她是卡罗林斯卡学院分子医学和外科的教授，也是卡罗林斯卡大学医院临床遗传学部的顾问。“通过这些举措，我们将临床专业知识与生物信息工具结合起来，共同提供准确的诊断和个性化治疗。”

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