跟踪疟疾寄生虫及其变异的全球运动

研究人员的国际合作已经制定了一种计算方法，以鉴定疟疾寄生虫，因为它们在世界各地与人类主持人转向衡量消除运动的影响。

由墨尔本大学教授Karen Day，Peter Doherty感染和免疫研究所的实验室头（Doherty Institute）和Bio21领导，团队收集寄生虫从10个国家的23个地点。

疟疾是世界上最致命的寄生虫疾病，每年导致超过50万人死亡。阻碍它的是耐药性最近开发的第一种疫苗只能提供部分保护。

团队从1,248次测序寄生虫DNA疟疾感染患者并建立了一个全球数据库在32,682个变体抗原基因中，追踪寄生虫起源的国家一级。10年项目的调查结果已发表于此Plos Genetics.。

“在疟疾中，我们必须在一个地方区域处理数万种变种。这个数据库是跟踪这些变体的重要一步，并了解疟疾如何在世界各地移动，”的一天说。

“这样做的影响是，我们可以遵循寄生虫迁移的当代模式，以一种成本效益高的方式，而不必测序整个基因组。过去的印记在我们的发现中非常明显，但现在我们可以看到是否有任何变化。它为我们提供了另一个窗口，让我们了解如何利用寄生虫基因组学来监测疟疾。”

戴教授说，这些进化发现在提供疟疾地理监测诊断框架方面具有转译意义。

她说:“它还可以帮助人们了解全球、地区和当地人口对特定变异的免疫是否存在。”

“我们的下一步将是扩大我们在亚太地区的数据库，提供更多的合作伙伴和区域培训机会。”

戴教授和她的研究团队正在努力的一个例子是类似于“FluNet”，这是世界卫生组织的一个全球网络流感监测工具。

“然而，疟疾寄生虫更多多样化我们正在谈论真正的大数据，”她说。

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