更具传染性和隐蔽性的SARS-CoV-2变种在巴西迅速增长

COVID-19,冠状病毒
这张扫描电子显微镜图像显示的是SARS-CoV-2(黄色),也被称为2019-nCoV,从患者体内分离的导致covid -19的病毒,从实验室培养的细胞(蓝色/粉色)表面出现。信贷:NIAID-RML

首次在巴西观察到的SARS-CoV-2变种的P.1系已经引发了第二波感染,即使是在第一波感染严重的地区。

这项研究结果来自圣保罗大学São与伦敦帝国理工学院和牛津大学合作的研究人员,它可能指出了再次感染的风险或传播性的增加。

P.1世界各地的血统

尽管亚马逊地区的感染率非常高,但在2020年12月至2021年1月期间,巴西玛瑙斯爆发了第二波感染。来自玛瑙斯的临床样本的基因组测序发现,这第二波与一种新的关注变体(VOC)的出现和快速传播有关,即P.1

基因组数据的统计分析表明,P.1系可能自2020年11月初以来一直在玛瑙斯流行。

该谱系已在全球20多个国家确认并继续传播,包括最近在英国确诊的几例。

几个-替换和缺失-在这个新的P.1系可能有免疫学意义。该团队确定了这种VOC的17个突变,包括刺突蛋白(K417T、E484K和N501Y)中的3个突变,它们与人类ACE2受体的结合增加有关。ACE2受体是一种位于细胞表面的蛋白质,在SARS-CoV-2中起着进入细胞的作用。通过对基因组序列数据的分析,研究人员可以将P.1 VOC的出现追溯到2020年11月初。

更容易传播,也更隐晦

研究人员发现,新的P.1谱系在巴西生长迅速,可能比其他变异更具有传染性,并可能具有逃避保护性免疫的能力。研究人员估计,P.1 VOC的遗传能力是非VOC血统的1.4-2.2倍。此外,他们估计P.1挥发性有机化合物规避了25-61%的保护性免疫力,这些免疫性免疫性是由先前的循环变异感染引起的。目前还不清楚增加传播性和逃避免疫力之间的确切权衡。

该小组的结论是,加强对可能表现出更强传播性和(或)免疫逃避的关切变异的全球基因组监测,对于加快对大流行的反应至关重要。

伦敦帝国理工学院的Nuno Faria博士说:“我们的研究描述了一个被关注的新世系,命名为P.1世系,它出现在亚马逊最大的城市玛瑙斯,那里观察到很高的人口免疫力。P.1累积了17个突变,包括刺突蛋白区域的3个病毒学上重要的突变,这些突变与病毒用来进入人体细胞的受体相互作用。”

伦敦帝国理工学院(Imperial College London)的托马斯·梅兰(Thomas Mellan)博士说:“我们发现,与此前在玛瑙斯流行的菌株相比,P.1变种有显著差异。”我们估计其传播性增加了1.4至2.2倍,并有能力逃避由早期菌株感染产生的25至61%的自然免疫。也有证据表明死亡风险增加,但这是由于P.1还是玛瑙斯经历的大规模医疗保健崩溃,仍不确定。”

圣保罗大学的Ester Sabino教授说:“快速病毒基因组测序的全球合作使我们能够近实时地识别SARS-CoV-2病毒的谱系。然而,SARS-CoV-2变化方式的不确定性以及对疫苗设计的影响,需要全球范围内对病毒基因组进行更多的测序和分析。”

与研究作者的问答:

P.1家族有什么独特之处?

与之前流传的变异相比,P.1系有异常多的突变,包括位于刺突蛋白区域的三个感兴趣的突变,这些突变与病毒用来进入人类细胞的受体相互作用。

P.1家族在没有被发现的情况下流通了多久?

第一例确诊感染发生在2020年12月6日。然而,根据基因组数据的统计分析,研究人员估计,P.1系可能自2020年11月初以来一直在马瑙斯流行。

P.1系比其他系更具遗传性吗?

根据目前已知的情况,研究人员估计P.1家族的传染性是其1.4到2.2倍。这种情况可能会随着时间的推移而改变。

P.1系比其他系更善于逃避免疫吗?

部分免疫逃逸是可能的。不可能提供一个确切的数字,但据估计,P.1回避了先前流行毒株感染所造成的25%至61%的免疫力。这意味着100名之前感染非p - 1的人在玛瑙斯传播的SARS-CoV-2血统中,如果接触到玛瑙斯的P.1,其中25至61人可能再次感染。

P.1系比其他系更致命吗?

研究发现,与之前在玛瑙斯流行的变异相比,P.1与死亡风险增加1.1-1.8倍有关。然而,马瑙斯的卫生系统在第二次浪潮中崩溃了,因此尚不清楚死亡风险的增加是由于P.1还是由于第二次大浪潮对卫生系统造成的压力。因此,围绕这一效应的不确定性,以及它如何在玛瑙斯之外的背景下进行概括,是相当大的。

疫苗还能保护我们不受P.1病毒的感染吗?疫苗可以预防感染,预防疾病或死亡。这项研究表明,该病毒可能导致更严重的疾病。然而,本研究只考虑了获得性免疫,没有研究疫苗的有效性。没有证据表明目前的疫苗对P.1系的有效性较低。

病毒的变化有多快?

目前,我们发现它每个月会产生一到两个新的突变。病毒突变的变化速度与世界上的病例数有关,我们减少的病例数越多,病毒变异的速度就越慢。


进一步探索

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更多信息:巴西的新型SARS-CoV-2 P1谱系。github.com/CADDE-CENTRE/Novel-…02 - 2021 _combined.pdf
引用:更具传染性和隐蔽性的SARS-CoV-2变种在巴西迅速增长(2021年,3月2日),2021年4月23日从//www.puressens.com/news/2021-03-transmissible-evasive-sars-cov-variant-rapidly.html检索到
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