研究:英国变体在英国疗养院迅速传播

伦敦大学学院(UCL)研究人员的一项研究显示,去年11月和12月,SARS-CoV-2的英国变种在英国的养老院迅速传播,大体上反映了它在普通人群中的传播。
该研究以信件的形式发表在新英格兰医学杂志,研究了10月至12月间养老院工作人员和居民的PCR阳性检测。它发现,在它获得的样本中,由新变种引起的感染比例从11月23日开始的一周的12%上升到两周后12月7日开始的一周的60%。
在英格兰东南部,这种基因变异最为盛行的地区,这一比例同期从55%上升到80%。在变异传播最快的伦敦,这一比例从20%上升到66%。
研究人员表示,感染的时机表明,这种新变体可能已经从工作人员传给了居民,老年人中出现阳性病例的时间较晚。
该研究的资深作者Laura Shallcross博士(伦敦大学学院健康信息学研究所)说:“我们的研究结果表明,英国变体在英国的传播速度一样快照顾家庭就像在一般人群中一样。这表明公共卫生措施在全国范围内减少传播的重要性。”
该研究的主要作者Maria Krutikov博士(伦敦大学学院健康信息学研究所)说:“我们的研究结果与全国趋势一致,表明英国的这种变异从早期就出现在养老院中,尽管我们的研究发现了这种变异。样本没有完全代表英格兰的所有护理家园。正如我们在12月在这项工作中开展这项工作,我们就可以在当时提供公共卫生决定。
“要了解像COVID-19这样的病毒是如何变化的,并做出快速和适当的反应,我们有一个先进的监测系统是非常重要的,它具有基因测序,可以尽早识别新的变异。”
在这项研究中,研究人员分析了4442份来自英国养老院工作人员和居民的阳性PCR样本。这些都是10月至12月在英国最大的实验室之一米尔顿凯恩斯的灯塔实验室(Lighthouse laboratory)进行的工作人员和居民的检测结果新冠病毒测试实验室。护理院的工作人员每周都要进行测试,而住院者每月都要进行测试。
SARS-CoV-2 PCR检测的目的是检测病毒的三个部分:S基因、N基因和ORF1ab。英国的变种,被称为B.1.1.7。它的S基因或刺突基因发生了变化,这意味着测试不能检测到这个特定的目标。
这意味着研究人员能够通过观察其他两个目标,N基因和ORF1b,而不是S基因被检测到的样本来确定新变异引起的感染的比例。
他们还比较了显示有多少病毒存在的Ct值,以检查样本没有漏掉S基因,因为它们的阳性检测“较弱”,病毒物质较少。
他们的分析显示,在11月底,在英格兰的几个地区,与B.1.1.7相关的感染比例急剧上升。在伦敦,这一比例从20%(11月23日开始的一周)上升到66%(12月7日开始的一周)。英格兰东部同期从35%上升到64%,而东南部则从55%上升到80%。这些数据主要来自伦敦、英格兰东南部和东部以及中部地区,英格兰北部和西南部的阳性检测样本较少。
大多数样本来自65岁以下的人,因为工作人员比居民接受测试的频率要高得多。然而,在65岁以上的样本中,由新变体引起的感染比例从11月23日开始的一周的14%上升到12月7日开始的一周的76%。(总阳性样本的数量很低,分别只有21和157。)
该研究是维瓦尔第关于护理中心COVID-19感染情况的研究的一部分。它得到了卫生和社会福利部的支持和资助。
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