人工智能模型预测免疫系统的哪个键打开冠状病毒的锁
对于Aalto University和赫尔辛基大学的研究人员开发的人工智能(AI)方法,研究人员现在可以将免疫细胞链接到他们的目标,而是涉及哪种白细胞识别SARS-COV-2。开发工具具有广泛的应用,以了解免疫系统在感染,自身免疫障碍和癌症中的功能。
人类免疫防御是基于的能力白血细胞准确识别致病病原体,并对其发起防御反应。免疫防御能够回忆起它以前遇到过的病原体,例如,疫苗的有效性就是基于这些病原体。因此,免疫防御是最准确的病人记录系统,它携带了一个人所面临的所有病原体的历史。然而,以前很难从患者样本中获得这些信息。
学习免疫系统可以大致分为两部分,其中B细胞负责产生对抗病原体的抗体,而T细胞则负责摧毁它们的目标。用传统实验室方法测量抗体相对简单,这就是抗体在医疗保健中已经有多种用途的原因。
赫尔辛基大学转译血液学教授Satu Mustjoki说:“虽然我们知道T细胞在抵御病毒和癌症等疾病方面的作用是至关重要的,但尽管进行了广泛的研究,确定T细胞的靶标一直很困难。”
人工智能帮助识别新的锁匙对
T细胞在键和锁定原理中识别它们的靶,其中键是T细胞表面上的T细胞受体,并且键是呈现在感染细胞表面上的蛋白质。估计个人携带更不同的T细胞键,而不是银河系中的恒星,使T细胞靶标具有繁琐的实验室技术。
因此,阿尔托大学和赫尔辛基大学的研究人员已经研究了之前描绘的钥匙-锁对,并能够创建一个人工智能模型,可以预测之前未绘制的T细胞的目标。
“我们创造的人工智能模型是灵活的,适用于每一种可能的病原体——只要我们有足够的实验生产的“钥匙-锁”对。例如,当有足够数量的新型冠状病毒SARS-CoV-2时,我们很快就能将我们的模型应用于这种病毒,”阿尔托大学博士生埃米·乔基宁解释说。
这项研究的结果帮助我们了解T细胞是如何使用钥匙的不同部分来识别它的锁的。研究人员研究了哪些T细胞可以识别普通病毒,如流感病毒、HI病毒和乙型肝炎病毒。研究人员还使用他们的工具来分析t细胞识别乙型肝炎的作用,乙型肝炎在肝炎发展为肝细胞癌后失去了杀伤能力。
该研究已在科学期刊上发表PLOS计算生物学。
用新型AI型号发布数据的新生活
人工智能生成的工具是具有成本效益的研究课题。
“在这些工具的帮助下,我们能够更好地利用已经发表的大量患者群,并对它们有更多的了解,”阿尔托大学计算生物学和机器学习教授Harri Lähdesmäki说。
使用人工智能工具,研究人员在其他方面讨论了防御反应的强度与其在不同疾病状态中的目标相关,没有这项研究,这将是不可能的。
“例如,除了Covid19感染之外,我们还调查了国防系统在各种发展中的作用自身免疫性疾病并解释了为什么有些癌症患者能从新药中获益,而有些不能,”赫尔辛基大学的博士生贾尼·胡塔宁博士说。
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