研究人员发现了乳腺癌转移的细胞相互作用

HSE大学的研究人员已经发现了在乳腺癌转移中起关键作用的基因。该研究结果发表在该杂志上《公共科学图书馆•综合》。

每个人体细胞都包含大量的分子: DNA、RNA、蛋白质等相互作用的基本分子类别之一是microrna，以及它们的目标基因和转录因子。小分子核糖核酸是小分子可以直接降低的浓度(表达)目标基因，而转录因子可以同时增加和减少microRNAs和基因的表达。在健康的细胞而在癌细胞中，某些相互作用被“破坏”了，从而使肿瘤得以扩散并逃避治疗。

生物和生物技术学院的专家Stepan Nersisyan和Alexander Tonevitsky，以及他们来自MSU的同事(Alexei Galatenko, Vladimir Galatenko)，已经开发了一种算法，可以重建癌细胞细胞间相互作用的网络。他们使用这个程序来检测导致乳腺癌转移的关键分子。

他们应用机器学习方法构建了一个模型，该模型建立了microrna、它们的靶标和转录因子的相互作用网络。该项目的一个关键特征是它能够整合不同的数据源，包括不同的交互数据库和样本集中被研究分子的表达谱(例如，在真实的肿瘤中)。程序免费在线。

作者使用乳腺癌相互作用网络来检测对乳腺癌最重要的分子癌症转移。反过来，转录因子E2F1成为许多标记基因的关键调控因子，它的表达帮助研究人员高精度地预测患者是否会发生转移。

“我们提出了一个假设，即建立的网络中最活跃的分子可以包含预后信息:如果在初始肿瘤出现后它们出现了问题，大量破坏的相互作用可能增加转移的可能性。初步结果表明，这一假设得到了证实。此外，大部分已确定的预后基因被证明与单个分子e2f1的活动直接相关。”HSE国际微生理系统实验室初级研究员Stepan Nersisyan指出。

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