“拼凑”肿瘤普遍存在于多种癌症类型中
弗朗西斯克里克研究所的研究人员,作为通过全基因组泛癌症分析联盟的科学家国际合作的一部分,已经分析了2600多名不同类型癌症患者的肿瘤样本的全基因组。他们发现在单个肿瘤中存在很高的遗传多样性,并进一步对其进行了描述。他们的发现证实,即使是在发展的后期,肿瘤进化也是由有利于癌症的变化驱动的。
当癌症细胞划分,在复制其DNA过程中发生错误。这些复制误差意味着不同的肿瘤可以由呈现出广泛遗传多样性的细胞组成。这种变异是医生作为一种治疗的挑战,该治疗适用于一组转基因相关的肿瘤细胞,称为亚克隆,可能没有对另一个替换的。某些亚克隆可以引发肿瘤扩散或耐药性。
癌症研究人员正在努力了解疾病过程中不同观点的这些亚克隆的演变是什么。
在他们的学习中,发表在细胞今天(4月7日),研究人员分析了涵盖38种癌症类型的2658个癌症样本的全基因组。他们发现95%的样本包含至少一个可识别的亚克隆。
他们还表明,癌症类型之间存在遗传变化的水平和类型。甚至在同一肿瘤中,不同亚克隆的遗传构成很大。
研究人员认为,这些亚克隆的产生是由于特定的进化压力在肿瘤发育的不同时期或影响肿瘤的不同区域。例如,抵抗特定的微环境条件,比如逃避免疫系统。
为了支持这一理论,他们发现了亚克隆的进化受到基因变化是否有助于癌症亚克隆的影响的证据。有优势的亚克隆更有可能发展。
克里克大学癌症基因组实验室的作者和小组组长彼得·范·卢说:“癌症是随着时间不断变化的,所以重要的是要认识到,从肿瘤中提取的样本反映了一个单一的时间点,癌症将在此之后继续发展。”它们可以成长为一个由不同突变和进化压力驱动的部分拼凑而成的拼图。
“了解更多关于子句的演变,为什么他们在一个方向上发展到另一个方向,以及他们的常见是多么常见,可以帮助医生更好地预测可能存在于特定癌症类型中的变异的水平和类型。”
该地区的研究已经表明,可以利用这种遗传多样性来预测生存或复发,这可以帮助医生和患者做出重要的治疗决策。
研究人员创建了一个开放式资源,记录了他们在子句中找到的遗传变异。它们的计算方法也可用于其他方法来分析癌症基因组。
Maxime Tarabichi,作者和博士在Crick的癌症基因组学实验室说:“我们组合了许多高品质计算方法分析这些复杂的遗传数据。令人放心,当我们以不同的方式将这些方法放在一起并通过独立的仿真将它们放在一起时,结果总是给出了相同故事的结果。“
进一步探索
用户评论