研究人员揭示小鼠中不同组织细胞的老化签名
研究人员已经确定了小鼠老化过程的分子鉴定,今天在开放式访问中发布结果el杂志。
他们的分析提供了在哺乳动物中不同组织的各种类型细胞中老化分子签名的最全面的特征之一,并帮助未来的老化和相关主题研究。
老龄化导致主要器官的下降,是许多疾病的主要风险因素,包括癌症,心血管和神经变性疾病。虽然先前的研究突出了老化过程的不同标志,但潜在的分子和细胞机制仍然不清楚。
为了更好地了解这些机制,塔巴拉默里斯联盟创建了单细胞转录组数据集,称为Tabula Muris Senis(TMS)。TMS含有来自23种组织和雌性小鼠的23种组织和器官的300,000多个注释细胞。“这些细胞被各种年龄的小鼠收集,使数据成为研究不同组织和造成衰老的遗传基础的巨大机会细胞类型,“哈佛大学流行病学系第一个作者Martin Jinye Zhang,哈佛大学,波士顿,波士顿,哈佛大学,张博士研究员。
原始TMS研究主要探讨了衰老的细胞形式效果,旨在表征不同组织内细胞类型组成的变化。在目前以基因为中心的研究中,张和同事专注于在不同细胞类型的老化过程中发生的基因表达的变化。
使用TMS数据,它们从23个组织中鉴定在76种细胞类型中的衰老基因。然后,它们表征了这些基因的老化行为,这些基因在所有细胞类型中共享(“全球”)和特定于不同的组织细胞。
“我们发现先前和当前研究的以细胞为中心和基因为中心的观点是互补的,如基因表达在老龄化期间可以在同一细胞类型内改变,即使组织中细胞的组成随时间没有变化,“Chan Zuckerberg Biohub,旧金山,美国旧金山的生物信息学助理主任“许多共同衰老基因的鉴定表明,小鼠中存在协调的全球老化行为。”
然后,该团队使用这种协调的活动来发展基于全球老化基因的单细胞老化分数。这种新的高分辨率老化分数显示,同一动物中不同的组织细胞类型可以具有不同的老化状态,脱落在不同类型的不同类型的变老过程上细胞。
“我们一起参加,我们的结果提供了老化的表征基因横跨各种各样的组织-Cell类型在鼠标中,“斯坦福大学生物医学数据科学助理教授詹姆斯教授詹姆斯·邹,斯坦福大学,美国和陈·扎克伯格生物冲动员。”除了为老化过程提供新的生物学识,这项工作为在相关领域工作的研究人员提供全面的参考。“
进一步探索
用户评论