一年的SARS-COV-2演变
研究已经出现了许多SARS-COV-2变体,从免疫功能度促成了免疫中心宿主。据认为,涉及的变异 - 包括B.1.1.7,在肯特中鉴定的一种变体 - 是免疫系统弱化的人的长期感染。
免疫功能低下的人持续感染可能会导致病毒更频繁地变异,因为人的免疫系统不能像健康人的免疫系统那样快速清除病毒。
作者教授Wendy Barclay,托马斯孔雀博士,Julian Hiscox和Rebekah Penrice-Randal教授解释了监测SARS-COV-2中的遗传变化,以便对病毒的未来控制进行监测:“随着越来越多的变种出现,我们得到了更好地了解他们共享的相似之处和差异,可以更好地预测其他新变种的样子。将所有这些信息一起放在一起,也将帮助我们设计助攻疫苗,以防止尽可能多的变体或设计目标诊断“。他们说。
他们的审查讨论了突变发生的地方,它们影响了哪些病毒以及所得变体如何影响疫苗接种努力。根据作者,预期SARS-COV-2中的突变,因为病毒适应人类。“人季节性冠状病毒的测序尚未在SARS-COV-2等规模上进行,特别是当他们最初蔓延到人类时。SARS-COV-2是在人类的旅程中开始,而其他人冠状病毒在某些情况下,在某些情况下,几十年来的是“他们说。
不同国家独立出现了具有相同或相似突变的变异:“从最佳感染和传播的角度来看,SARS-CoV-2可能仍在人类中寻找途径。疫情的规模和大规模测序工作将确定同时发生的突变;基本上,病毒在世界上任何地方都经历着同样类型的选择压力,而疫情都是由同样的原始病毒播下的种子,”作者解释说。
特殊的突变包括刺突蛋白的突变。该蛋白允许病毒进入宿主细胞,是免疫系统的主要目标,包括目前所有SARS-CoV-2疫苗产生的免疫。
基因中的突变可以改变蛋白质的形状,使其不再被免疫系统识别。因为该蛋白对SARS-COV-2进入这么重要,所以有利的突变更可能成功并创造病毒的新占状变异性。
为病毒提供优势的变化可以迅速成为主导。例如,一个名为D614G的一个突变,在首次检测到40个月的SARS-COV-2病毒中发现了80%的病毒。现在,没有D614G突变的病毒仅在非洲的部分地区看到。
SARS-CoV-2变种B.1.1.7中发现了另一个突变N501Y。这种变异被认为是免疫缺陷个体感染的结果,可能导致病毒更具传染性。这种变异的感染有较高的致死率。在英国,B.1.1.7在3个月内成为主要的变异,现在在那里超过90%的感染是由它引起的。
本文讨论的显著突刺蛋白突变包括:
D614G:
2020年2月,在SARS-CoV-2突刺蛋白中检测到一个突变,命名为D614G。人们发现,这种突变使SARS-CoV-2更具传染性,但并不使病毒更有害。这种传染性的增加带来了显著的适应度优势,在四个月内,世界各地测序的80%的SARS-CoV-2病毒被发现有这种突变。现在,只有部分非洲地区的传播病毒没有D614G突变。
尽管最初存在担忧,但D614G对疫苗效率没有影响,而且在某些情况下,具有D614G突变的病毒更容易被抗SARS-CoV-2抗体清除。
Y435F:
2020年代中期,人类感染的貂蝉报道频繁。在貂皮中,病毒的尖峰蛋白常见地开发出称为Y435F和N501T的两个突变。这些突变允许病毒与人受体细胞的较强结合。在丹麦的人类感染群中发现了具有这些突变的病毒,据信起源于貂皮。有意义地,这种变体能够感染以前被SARS-COV-2感染的人,并被认为对病毒具有一些免疫力。结果,剔除了1700万貂皮。
据报道,突变Y435F尚未在免疫功能化的人中开发,可能是由于慢性感染与病毒允许它适应。
n501y:
2020年12月,在英国肯特的病毒中孤立的高度传染性变体。该变体命名为B.1.1.7,含有尖峰蛋白质的突变,称为N501Y。这种突变不仅使病毒更具传染性,而且还发现它具有更高的死亡率。在英国,B.1.1.7现在是主要的变种,并负责超过90%的感染。
已发现突变N501Y对疫苗和先前感染的影响几乎没有影响免疫。
E484K:
最近几个月,穗蛋白突变E484K曾在南非和巴西至少两次。具有E484K突变的变体能够避免疫苗和预先感染的个体的免疫系统。
认为这种突变是受高水平的群体免疫驱动的推动,这使得穗蛋白中的突变蒸发免疫系统。在巴西,有几个医疗保健工人和其他患有针对SARS-COV-2抗体的人的报告,用E484K突变体重新感染,提高对该变体的疫苗保护的担忧。
审查还检查了对病毒的其他部分变化的突变,例如ORF8,旨在追究宿主免疫系统的辅助蛋白。已经发现在基因中缺失的病毒已被发现编码ORF8造成不太严重的临床疾病。
该评论的作者呼吁增加全球监测SARS-COV-2突变的努力。目前联合王国和丹麦对SARS-COV-2基因组进行了不成比例的高序列。对病毒的定期监测允许早期识别新出现的变体,并允许研究人员识别相关的突变。
“虽然欧洲和美国的基因组监测相当强劲,但它变得明显,世界上有很大的领域,我们根本不知道什么变异是流动的。这些是在欧洲出现的进口或社区爆发。更好的监视在更广泛的国家,允许我们更好的风险评估流行病的下一阶段可能看起来像什么,“作者说。“如果我们希望监测潜在疫苗逃生突变体的持续出现,传播和进口,我们必须继续这种努力或风险进一步的大流行波和疫苗衰竭。此外,尽早了解病毒的基因组流行病学将允许我们快速发展更新的疫苗助推器。“
Alain Kohl教授,副主任常规病毒学杂志“SARS-CoV-2变种的出现是当前大流行的巨大挑战之一。这篇综述文章总结了我们目前对这种病毒的进化及其后果的认识和理解,例如在疫苗接种方面。任何希望更多地了解这一历史的人都对此非常感兴趣病毒和未来可能持有的内容。“
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