2021年5月26日,

研究人员开发新工具以战斗癌症，提前基因组学研究

弗吉尼亚大学医学院(University of Virginia School of Medicine)的科学家们开发出了重要的新资源，将帮助抗击癌症并推进前沿基因组学研究。

弗吉尼亚大学的臧崇志博士和他的同事和学生开发了一种新的计算方法来绘制我们染色体的三维折叠模式实验数据。这很重要，因为我们染色体内的遗传物质的配置实际上影响了我们的基因如何工作。在癌症，这种配置可能出错，所以科学家想了解健康细胞和癌症的基因组结构。除了推进许多医学领域之外，这将有助于他们制定更好的治疗和预防癌症的方法。ob欧宝直播nba

利用他们的新方法，臧和他的同事和学生已经出土了一个有用的数据的宝库，他们正在向他们的科学家提供他们的技术和调查结果。推进癌症研究，他们甚至建造了一个互动网站这将他们的发现与来自其他资源的大量数据结合起来。他们说，他们的新网站bartcancer.org可以为癌症研究人员提供“独特的见解”。

“基因组的折叠模式是高度动态的;它经常变化并与细胞不同。我们的新方法旨在将这种动态模式联系起来控制基因活动，”UVA公共卫生中心的计算生物学家说：“Zang说基因组学和UVA癌症中心。“更好地了解这一联系可以帮助解开癌症和其他疾病的遗传原因，并可以指导未来的药物开发精确药。”

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臧教授绘制人类基因组折叠图谱的新方法叫做BART3D。本质上，它将一个染色体区域的三维结构数据与其相邻区域的数据进行比较。然后，他们可以利用“转录调控结合分析”(BART)——一种他们最近开发的新算法，从这种比较中推断出填补遗传物质蓝图中的空白。其结果是一幅地图，为我们提供了前所未有的洞见，了解我们的基因如何与控制其活动的“转录调控因子”相互作用。识别这些调节因子有助于科学家了解是什么开启和关闭特定基因，这些信息可以用于对抗癌症和其他疾病。

研究人员建造了一个web服务器为他们的科学家同行提供BART工具。它可以在以下网站免费获得bartweb.org。研究人员报告称，测试结果表明，在识别控制特定基因组的转录调控因子方面，该服务器的表现优于现有的几个工具。