研究人员确定下一代Covid-19疫苗的潜在新目标

与其他已知的肽相比，由SARS-COV-2基因组的未探测肽的肽引起了强烈的免疫应答。

目前的Covid-19疫苗可有效预防严重疾病，包括所知的令人担忧的变种引起的感染。但SARS-COV-2病毒的新变种可能会避免免疫力，所以疫苗制造商已经开始开发下一代疫苗。最近的研究表明，新的疫苗更加棘手刺激免疫系统的T细胞可以对病毒提供更长持久的保护，特别是对新变种。

发表了一项新研究细胞揭示了新的方式下一代疫苗可能潜在刺激病毒的T细胞。科学家分析了病毒基因组的先前被忽视的部分，并揭示了令人惊讶的大部分关键病毒蛋白片段，或肽，这引发了比其他已知肽更强的T细胞应答。来自广泛的麻省理工学院和哈佛大学和其他人的研究人员的调查结果可以帮助疫苗制造商确定未来疫苗的更好的病毒目标，刺激耐用的Covid-19病毒的耐用免疫力。

“科学家正在考虑将组件纳入调用T细胞反应的疫苗，因为它似乎可能会对新兴变种提供长时间的感染，”研究所成员帕迪斯·萨比蒂实验室的博士后研究员Shira Weingarten-Gabbay表示，“Shira Weingarten-Gabbay说这项研究的广泛和联合第一作者。

“越来越清楚的是，当谈到争夺SARS-COV-2时，T细胞免疫力具有非常重要的作用，”波士顿大学国家新出现的传染病实验室（Neidl）的莫山赛德，联合高级作者和病毒学家说。

免疫系统的两个臂

当体内遇到病毒时，它会引发两种免疫应答。在B细胞介导的免疫中，免疫细胞使抗体中和病毒。在T细胞介导的免疫中，感染的细胞用细胞的人白细胞抗原（HLA）蛋白质剁碎病毒蛋白和细胞表面上的那些蛋白质的碎片。这些肽的作用类似于用于细胞杀灭T细胞的信标，这在感染细胞发射攻击并从身体中消除它们。

这些T细胞如何与SARS-COV-2病毒相互作用是一个活跃的研究领域。“在过去的几个月里，有更多的和更多的研究表明，对新变体的T细胞反应与对父病毒的T细胞反应相同，“Weingarten-Gabbay说。这是一个关键发现，因为它意味着疫苗设计用于刺激T细胞的疫苗当新的和有关病毒变体出现时，可能不需要更新免疫力。

对于这种更一致的T细胞响应的一种可能的解释是疫苗诱导的抗体通常靶向病毒的刺蛋白。该蛋白质是病毒最可变的区域之一，并且抗体可能无法检测在新的病毒变体中高度突变的尖峰蛋白。通过对比，生物肽或表位，产生T细胞应答的来自许多病毒蛋白，其通常比单独的尖峰蛋白更遗传稳定。

SARS-COV-2基因组探索

了解T细胞介导的免疫力的重要性，该团队于2020年4月迅速发动到行动。Weingarten-Gabbay长期以来对病毒抗原感兴趣，并与广泛的蛋白质组学平台的Co-First作者Susan Klaeger合作，以表征来自SARS的肽 -COV-2和其他在HLA上的病毒。Weingarten-Gabbay也与Saeed一起进行了合作，他们开发了专门的细胞系来研究SARS-COV-2感染，并且具有高度传染性病毒进行实验所需的培训和生物安全3级设施。

当时，Saeed的实验室只有一岁，已经被合作要求所淹没。“但我决定加入Shira和Susan，因为拟议的研究对我来说非常令人兴奋，”他说。“我一起认识我们将拥有所有的专业知识和资源来快速完成这项工作并以有意义的方式分析数据。”

与SISI SARKIZOVA一起，在广泛的和第一作者的电池电路计划中是一个计算科学家;和詹妮弗阿贝林，也有蛋白质组学平台和联合高级作者;该团队旨在研究SARS-COV-2感染的肽细胞使用质谱。

质谱对该研究很重要，因为它允许科学家以未明确的方式寻找病毒肽。以前的SARS-COV-2中T细胞免疫研究使用了更多常规方法，并且主要集中于衍生自病毒基因组特异性区域的肽称为规范开放阅读框（ORF）。但球队看出了叫做非洲ORF的基因组的其他部分，也是直接鉴定来自这些地区的肽。“质谱的美丽是它是高吞吐量，并且它允许我们发现新表位而不先验知识的目标序列，”Klaeger说。

该团队惊讶地发现，由于其质谱实验揭示的四种肽中的许多肽的源自非规范性ORF，表明许多疫苗的潜在靶标被忽视。

强烈的免疫反应

为了探讨肽的功能作用，该团队与马萨诸塞州综合医院，达纳 - 前癌症研究所，La Jolla Immunolocy研究所和曲目，成为专业的T细胞测定的生物技术公司，以测试HLA绑定和t细胞反应。该团队发现，一些隐藏的肽引发了来自Covid-19患者的小鼠和血液样本的研究中的研究中的其他肽的更强烈的免疫应答。也许最令人惊讶的是，该团队发现一个隐藏的肽 - 来自叫做ORF9B的非甘露解ORF - 在患者中表现出更强的反应，而不是迄今为止描述的一些最疫苗的主要表位。结果表明肽可以是下一代疫苗的理想目标;研究团队已经与研究疫苗开发的科学家分享了他们的调查结果。

该团队还发现了用于治疗干预的其他潜在目标，包括来自细胞蛋白质途径的蛋白质，当SARS-COV-2抑制时，可以帮助病毒避免免疫系统。作者称，改善对病毒免疫逃避战术的理解可以帮助科学家设计新的策略来干扰感染。

总体而言，结果表明科学家如何研究身体对SARS-COV-2的免疫反应的仔细重新定位。“这是非常令人瞩目的，”Weingarten-Gabbay说。“来自病毒的这些非常强大的信号是我们对此视而不见，因为我们正在寻找我们认为是最重要的地区病毒。“

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