细胞类型特异性洞察冠状动脉疾病危险因素的功能
利用单细胞技术,一项新的研究揭示了遗传风险因素的重要性,以及参与冠状动脉疾病发展的细胞多样性。研究人员分析了人类动脉粥样硬化病变,绘制了7000多个细胞的染色质可及性图谱。染色质可及性反映了基因组中的活性区域和基因。研究结果发表在循环研究.
人类基因组的全基因组关联研究已经确定了200多个与冠状动脉疾病相关的基因座。其中90%以上位于蛋白质编码基因之外,即所谓的顺式调控元件,其在冠状动脉疾病发病机制中的意义尚不清楚。
先前的研究表明,冠状动脉疾病的发展涉及多种细胞以及它们的亚型。现在发表的这项研究是第一次使用单细胞技术来绘制这些细胞的表观遗传变化。研究人员利用ATAC-seq测序方法发现了内皮细胞、平滑肌细胞以及免疫系统单核细胞、巨噬细胞、NK/T和B细胞的核染色质结构,为研究顺式调控元件在血管壁病变中的细胞型特异性活性提供了独特的资源。
该研究表明,与冠状动脉疾病相关的遗传风险变异尤其富含内皮细胞和血管内皮细胞特异性的顺式调控元件平滑肌细胞这表明这些细胞在传递对疾病的易感性方面起着重要作用。基于染色质可及性制图和基因表达数据,研究人员能够确定大约30%与冠状动脉疾病相关的已知基因座的假定靶基因。此外,研究人员对变异进行了全基因组实验精细定位,使他们能够识别与冠状动脉疾病相关的30多个位点的潜在因果单核苷酸多态性和相关靶基因。该研究还提出了一些例子,说明如何使用染色质可及性和基因表达数据来预测靶细胞,通过靶细胞,与疾病相关的遗传变化的功能在组织中传播。这是向前迈出的重要一步,有助于理解风险变异在冠状动脉病理生理中的真正功能意义疾病.在未来,这些信息可以用来开发更有效、更安全、更个性化的治疗方法冠状动脉疾病.
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