DNA标签使blood-based测试来评估癌症治疗的结果
DNA (cfDNA)脱落进入血液游离在1940年代被发现,但迅速发展的基因组学和计算分析在过去的几年里,乔治敦Lombardi综合癌症中心的研究人员现在认为,研究标签,或修改这种类型的DNA,可能导致更好的理解如何评估,并可能调节、治疗癌症和其他疾病的方法。回顾研究的角度来看,到目前为止,出现在7月27日遗传学前沿。
在细胞死亡,这是一个正常的一部分组织从组织再生,cfDNA棚。小屋cfDNA可以隔绝血液样本,从而提供一个阅读的整个身体在正常和细胞死亡癌症细胞不需要采取侵入性活检样本。
“以肿瘤组织切片是一个无计划的过程,通常不是一个好的表示整个肿瘤或其蔓延,”安东Wellstein说,医学博士,博士,肿瘤学和药理学教授乔治敦Lombardi并为本文通讯作者。“使用血液或液体活检,另一方面,提供了一个均匀的cfDNA表示从所有类型的流细胞。"
科学家们指出,短的DNA片段和化学修改这些碎片,被称为甲基,帮助告诉研究人员细胞类型相应的片段的DNA来自因为这些甲基化模式是独特的特定细胞类型。通过使用cfDNA比较从各种形式的损伤细胞治疗的正常细胞相同的组织,研究人员可以分析珍贵的数据是如何组织的细胞治疗和其他外部力量的影响。这些知识可能是关键在评估如果治疗是有效的,它可能会造成什么不利影响。
“微调cfDNA分析这些应用程序是具有挑战性的,需要深入的方法,在基因组测序水平和计算,”梅根解释说光着脚,MD /博士。学生Wellstein实验室癌症中心和文章的作者。“甲基化cfDNA打开了一个新的微创方法检测体内受损细胞,经常有数百个甲基标记每个细胞可以马克,非常特别,细胞从何而来,就像一个“条形码扫描器”在一家杂货店结账告诉商店特定产品的身份。结合生物学和计算分析实现破译这些甲基化模式/分子条形码,以便研究人员跟踪cfDNA的起源。”
这些分析的归宿艾滋病调查人员在决定组织的起源癌症例如,并且允许研究人员,当比较健康细胞受损细胞,损害源自哪里,尤其是如果它是由于某种类型的治疗。
”这种方法可以应用于任何治疗,将会影响组织的平衡,导致组织细胞受损和死亡,包括化疗、放疗、免疫治疗。本文真正有助于为未来的研究工作,”Wellstein总结道。“我的实验室很积极追求的方法和技术,进一步细化分析甲基化cfDNA。我们相信这些努力是负担得起的,很快就会成为标准实验室和他们应该做出改变在推进的理解和治疗许多癌症。”
更多信息:梅根·e·赤脚et al,检测细胞从循环导致癌症,游离DNA甲基化,遗传学前沿(2021)。DOI: 10.3389 / fgene.2021.671057