研究人员发现核苷酸序列负责有效地对抗病理
HSE大学的研究人员发现了具有microRNA亚型特征的核苷酸序列(带有错误的microRNA)。这一发现将有助于预测microRNA行为的错误,并创造出能够更有效地检测目标(如病毒)的药物。这项研究的结果已经发表在RNA生物日报》。
MicroRNAs (miRNAs)非常小分子调控细胞内所有过程,包括RNA或蛋白质中遗传信息的转化(基因表达)。每个microRNA都有自己独特的一组靶基因,这些靶基因的活性可以被抑制。最近的研究表明,即使是微小的microRNA核苷酸序列变化(所谓的microRNA异构体或异构体)也可以完全重建大量的靶标。这可能会彻底改变分子的生物功能。然而,直到最近,研究人员还不知道为什么有些microRNAs具有同工型,而另一些则没有。
HSE生物与生物技术学院的研究人员Anton Zhiyanov, Stepan Nersisyan和Alexander Tonevitsky运用生物信息学的方法来寻找这个问题的答案。该团队成功地创建了一种算法,描述了具有异构体的microRNAs和不具有异构体的microRNAs之间的基本区别。
他们的研究对人造生物的创造也有重要的应用分子类似于小分子核糖核酸。全球数十个研究团队目前正在努力解决这个问题。研究人员人工合成类似于微rna(所谓的短发夹rna或shRNAs)的分子,以“敲除”他们感兴趣的基因。除了学术应用之外,这项技术还被用于抑制导致疾病的“坏”基因的治疗。
这项研究的作者证明,这种人工合成的分子也可以具有同型。
“一些核苷酸的组合(AGCU, AGUU)最常在没有错误发生的microRNAs中发现。CCAG及其变体等组合可以预测变化和目标失效,精度高达70%。对我们自己实验中的短发夹rna进行测序,发现它们也有异构体。这意味着,有可能出现这样的情况:我们发明了一种具有特定靶标的分子,但在实践中,异构体本身也有意想不到的靶标。我们的算法有助于在计算机分析阶段预测这些事件,而不必进行昂贵的实验,”HSE国际微生理系统实验室的初级研究员Stepan Nersisyan说。
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