免疫反应SARS-CoV-2变异研究
![The web interface of T-CoV. (A) Top part of the page contains SARS-CoV-2 variant name, list of protein-level mutations, short introduction and two navigation panels: through viral proteins and different HLA alleles. (B) A single mutation analysis includes a fragment of pairwise sequence alignment (the reference variant and the variant of consideration) and a table with HLA-peptide interactions significantly affected by the analyzed mutation. (C) Allele-specific differences between numbers of T-cell epitopes from the reference virus and the variant of consideration (plot was constructed for the Delta variant). Left panel stands for the absolute number of peptides, while the right panel represents percentage of tight HLA-peptide interactions (absolute number relative to the number of tight-binders in the reference immunopeptidome). Credit: DOI: 10.1093/nar/gkab701 免疫反应SARS-CoV-2变异研究](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2021/immune-response-to-sar.jpg)
HSE大学的研究者们评估了t细胞免疫反应的有效性SARS-CoV-2 11变体。研究人员用他们的结果发展门户(T-CoV) t细胞COVID-19地图集。研究结果已发表在核酸的研究。
不断出现新的SARS-CoV-2突变允许病毒更有效地传播和逃避抗体。然而,目前尚不清楚新菌株能够逃避t细胞免疫的身体的防御COVID-19的主要线路。
t细胞的发展免疫反应在很大程度上是由遗传因素,包括变异基因的主要组织相容性复合体(也称为HLA)。每个HLA基因变体都有一个相应的分子标识一组特定的肽(蛋白质)的病毒。有大量的这样的基因变异,和每个人都有一组独特的。
t细胞免疫的发展的有效性COVID-19因人而异。根据HLA分子的集合,有些人的免疫系统会识别和摧毁一个变异病毒相同的功效,因为他们将病毒的基本形式。别人的反应就没那么有效了。
这项研究是由一群科学家从HSE大学学院的生物学和生物技术和有机化学研究所的俄罗斯科学院,包括斯捷潘Nersisyan,安东Zhiyanov,马克西姆Shkurnikov,亚历山大Tonevitsky。他们评估了基因功能的t细胞免疫的发展到11主要SARS-CoV-2变体通过分析最常见的HLA基因变异。研究人员用他们的结果发展t细胞COVID-19 Atlas门户(T-CoV,https://t-cov.hse.ru)。
研究人员使用生物信息学评估的结合亲和力HLA分子变化和成千上万的病毒肽的主要SARS-CoV-2变体(α、β、γ、δε,ζ,η,θ,极微小,卡帕和λ)。团队确定HLA等位基因显示最显著改变的识别病毒多肽。科学家认为,基因突变可能与这些等位基因对人构成风险更高。
”t细胞免疫的变化和t细胞受体HLA分子阻止病毒逃避免疫应答。我们的研究没有发现一个HLA基因型变体病毒变异显著负面影响的方法。这意味着,即使在条件降低抗体的有效性,t细胞免疫继续有效运作,”院长说亚历山大·Tonevitsky HSE大学生物学和生物技术学院。
更多信息:斯捷潘Nersisyan et al, T-CoV:综合门户HLA-peptide交互影响SARS-CoV-2突变,核酸的研究(2021)。DOI: 10.1093 / nar / gkab701