DNA的修改可以用来确定严重肝脏疾病的进展

研究国家发现由平动基因组学研究院(TGen)一个附属的城市希望,识别潜在的生物标记物,最终可能被用来诊断肝脏疾病的进步阶段。

研究人员发现DNA甲基化的差异(DNAm),准确地预测肝纤维化的不同阶段,肝脏受损的疤痕,在多达94%的患者非酒精脂肪肝(NAFLD),根据这项研究发表在《华尔街日报》临床实验胚胎学。

非酒精性脂肪肝是最常见的慢性肝脏疾病在西方国家中,以积累的脂肪在肝脏。甲基化是一种生物过程在甲基被添加到DNA分子。这个过程可以改变不改变其DNA序列的活动,或拼写,数十亿的字母组成一个人的基因蓝图。

“DNAm模式可用于识别不同的细胞在肝脏,和程控成分改变,“Johanna DiStefano说,博士,教授TGen代谢和纤维化疾病项目,和头部TGen糖尿病和纤维化疾病单元。她是该研究的资深作者之一。

研究调查了325名患者的数据

使用由活检样本检索,研究人员检查了从325例非酒精性脂肪肝患者基因组数据:206年,没有明显的肝脏瘢痕,和119年不同程度的纤维化,而最严重的形式可以进步称为非酒精性脂肪肝(NASH)的条件,从而导致肝硬化,肝癌和死亡。

使用DNAm估计这些样本的细胞组成,研究人员发现,更严重纤维化水平逐渐增加的百分比免疫细胞在肝脏,上皮细胞的比例相应减少,行各种身体表面的细胞类型,包括器官等肝。

凯伦Conneely博士在美国人类遗传学副教授埃默里大学医学院和该研究的资深作者,解释说,研究人员还发现,即使占细胞组成个体间的差异,DNAm水平在基因组中特定部位减少患者严重纤维化。足够引人注目的差异,艾莫利大学的尼古拉斯•约翰逊博士,以及该研究的第一作者,能够开发一个模型基于DNAm 28基因组的网站,可以准确地预测94%的非酒精性脂肪肝患者纤维化水平在一个独立的测试集。

“这些发现符合DNAm机制支撑,或标记,fibrosis-related变化在细胞组成,并展示的潜力DNAm NAFLD纤维化的可能的生物标志物,“秀梅Wu说,博士,DiStefano TGen科学家的实验室,该研究的作者之一。

展望未来的研究

在这项研究中,样本直接来自病人通过相对入侵肝脏活检的使用。利用技术开创TGen,他们认为,未来可能从血液循环获得样品。

“循环DNAm已经被认为是一个潜在的无创生物标记为非酒精性脂肪肝疾病的严重程度,”这项研究说。“这些结果表明,我们的模型可以预测非酒精性脂肪肝在血液DNAm纤维化。”

未来的分析还可以补充利用RNA单细胞测序,分析基因组信息的更严格的方法,有可能测量细胞成分在更高的分辨率,并促进更大的理解非酒精性脂肪肝纤维化之间的关系,细胞成分,DNAm。

“总的来说,我们的调查显示,DNAm提供信息,不仅有助于理解NAFLD的潜在生物学,”DiStefano博士说,“但也可以作为一种临床工具独立诊断的能力纤维化。"

Geisinger肥胖协会也促成了这项研究。

这study-Differential DNA甲基化和改变程控比例作为NAFLD-was纤维化阶段进展的资助支持的国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所。