精神分裂症研究表明先进的基因记分卡不能预测病人的命运
在尖端计算机程序的帮助下,西奈山伊坎医学院的研究人员查阅了8000多名精神分裂症患者的基因和医疗记录。他们发现,在评估一个人患某种疾病的遗传风险的研究中常用的一种工具——多基因风险评分(polygenetic risk score)——并不比书面报告更好地预测患者的疾病结局。研究结果提出了在现实世界和临床情况下使用多基因风险评分的重要问题,也表明医生的书面报告可能是未开发的预测信息来源。
“治疗精神分裂症患者是一段令人心痛的经历。照顾病人最困难的部分之一是试图确定每个病人的病情是会恶化还是好转。如果我们能做到这一点,那么我们可能会帮助减轻患者和他们所爱的人所经历的痛苦,”亚历山大·w·查尼医学博士说,他是伊坎西奈山精神病学和遗传学和基因组科学系的助理教授,也是发表在《美国医学杂志》上的研究的资深作者自然医学.“我们的结果表明,对于精神疾病最深刻的特征是在遗传层面,目前的遗传学研究状态还不能解决这个问题。”
影响着全球约2000万人,精神分裂症是一个缩短精神障碍这改变了一个人思考、行动和感知现实的方式。通常,症状出现在十几岁到三十岁出头,并可能持续一生。虽然一些病人对治疗反应良好,但另一些则完全没有反应。
虽然它是一种高度遗传的疾病,但大多数病例不能与单一基因有关。相反,科学家们发现,精神分裂症的患病风险受到正常基因变异的复杂组合的影响,其中任何一种基因变异本身都不会造成很大的风险,但加在一起就造成了很多病例。目前,有近300种这样的变异与精神分裂症有关。
的多基因风险评分是一种常用的方法,用来总结一个人患某种疾病风险的遗传成分。在过去十年中,许多大型研究表明,精神分裂症患者的风险得分明显高于健康对照组。类似的结果也出现在对高血压和糖尿病等其他疾病的研究中。
“多基因风险评分基本上把与一种复杂疾病相关的所有特征加起来。最初它被设计成描述工具。最近,科学家们提出,它可能是精确医疗的一个有效工具,其中一个人的基因被用于诊断疾病和预测结果,”查尼博士实验室的博士后研究员、该研究的主要作者Isotta Landi博士说。“在这项研究中,我们想严格测试多基因风险评分是否也可以作为预测工具。”
首先,研究人员比较了储存在西奈山卫生系统BioMe生物银行项目中的762名精神分裂症患者的基因和医疗记录。具体来说,他们测试了患者的精神分裂症多基因风险评分是否能比医生撰写的医疗报告更好地预测每个患者的六种不良预后。
为此,兰迪博士与其他人合作开发了先进的计算机程序,根据患者的多基因风险评分计算多基因风险评分基因数据并使用自然语言处理工具从书面报告中提取信息。
他们发现其中两个结果——攻击行为和住院的需要——与较高的多基因风险评分显著相关。然而,这些分数在预测这些结果方面并不比从书面报告中获得的信息更有效,并且将两者结合并不会改变可预测性。
后续实验证实了这些结果。例如,当研究人员试图只预测多基因风险得分最高的人的结果时,他们发现结果没有变化。
最后,当他们分析基因和医疗记录基因组精神病学队列是美国国立卫生研究院资助的一个大型项目。再一次,多基因风险评分并没有提高临床数据预测不良结果的能力。
“我们的研究结果表明,我们还需要做更多的工作来利用遗传学的潜力来改善精神分裂症患者的治疗,”查尼博士说。“研究结果还表明,医生撰写的详细医疗报告可能包含比我们最初预期的更多有价值和可预测性的信息。”