Cancer-Immu:数据门户预测反应免疫检查点封锁免疫疗法

新数据门户叫Cancer-Immu建立了一个团队的范德比尔特大学医学中心的生物可以帮助癌症临床医生和研究人员预测哪些病人会对免疫抑制剂检查站。数据从3652年16癌症样本,Cancer-Immu是最大的免疫检查点blockade-related数据门户为探索immunogenomic连接。

团队提供的详细信息开放获取门户在12月13日发表的一篇论文癌症研究。Cancer-Immu大规模多维集成组学数据,包括遗传、批量和单细胞转录组、蛋白质组学和动态基因资料。它还集成了临床表型。

而免疫抑制剂检查站可以救命的一些癌症患者,多数病人不应对免疫疗法。研究人员正在努力确定预测反应的生物标记物,和Cancer-Immu解开immune-genomic连接提供了一个功能全面的门户。

“它提供容易获得免疫原性数据,使研究人员组学数据集转化为生物的见解和临床应用,”Yu说Shyr,博士,部门的主席在VUMC生物统计学,哈罗德·l·摩西椅子在癌症研究和论文的资深作者之一。根据气刘博士,副教授生物统计学和其他论文的资深作者,“Cancer-Immu覆盖尽可能多的数据集和组学数据类型相比,现有的数据库与免疫检查点封锁反应结果。”

的癌症在数据门户包括黑色素瘤、非小细胞肺癌转移性移行细胞癌,肾细胞癌,膀胱癌神经胶质瘤,结肠直肠癌、头颈癌、esophagogastric癌症,癌症的未知的主要原因,胃癌、乳腺癌、肝癌、前列腺癌、基底细胞癌和non-melanoma皮肤癌。

Cancer-Immu门户,临床医生和研究人员可以上传并分析自己的数据或co-analyze同时与现有数据。他们可以用元分析或pan-cancer分析。门户有三种类型的组学数据的集合:遗传,转录组和单细胞数据。pan-cancer模块,多个数据集聚集到一个,提高了罕见的检测和分析功能。这项研究指出,虽然荟萃分析——统计评价独立研究集中在同一question-failed检测重要的基因突变,pan-cancer分析,这是一个更广泛的评价跨多个癌症类型,检测到182个基因与免疫抑制剂检查站进行突变显著相关。

“Cancer-Immu有助于解决缺乏和疗效评估面临的挑战已知的生物标志物和发现新的签名,”这项研究的第一作者说,静阳博士,博士后Shyr研究实验室。