严重COVID-19与其他疾病之间发现了遗传联系
对退伍军人事务百万退伍军人计划数据的一项新分析发现了COVID-19严重程度与某些已知的严重COVID-19危险因素之间的遗传联系。美国宾夕法尼亚州费城Michael Crescenz下士VA医疗中心的Anurag Verma及其同事在4月28日的开放获取期刊上发表了这些发现公共科学图书馆遗传学.
一些COVID-19患者的病情比其他人更严重。之前的研究已经确定了特定人类基因中的某些变异,这些变异与经历更严重的COVID-19的人有关。其中一些变异也可能与其他变异有关医疗条件这一点可能已经很好理解了;确定这些共有的变异可以提高对COVID-19的理解,并阐明潜在的新治疗途径。
为了确定共有的变异,Verma和同事使用了一个前所未有的基因型信息数据集,该数据集与超过65万名美国退伍军人的电子健康记录数据(EHR)相关联。他们进行了一种被称为全现象关联研究(PheWAS)的分析,以检查在经历严重COVID-19的退伍军人中经常发现的变异与与广泛选择的医疗条件相关的变异之间的联系。
分析显示,与COVID-19相关的某些变异也与COVID-19的已知危险因素相关。与静脉栓塞和血栓形成,以及2型糖尿病和缺血性心脏病-两个已知的COVID-19风险因素。
分析还发现,非洲和西班牙裔退伍军人的严重COVID-19与中性粒细胞减少症之间存在遗传联系;这些联系在欧洲血统的人身上没有出现。
在呼吸道疾病中,特发性肺纤维化慢性肺泡性肺疾病基因的链接以及其他呼吸道感染慢性阻塞性肺疾病(COPD)则没有。与严重COVID-19相关的一些变异也与牛皮癣和狼疮等自身免疫性疾病的风险降低有关。这些发现强调,在开发新的治疗方法时,需要仔细权衡免疫系统的各个方面。
尽管PheWAS方法存在一些局限性,但这些发现有助于加深对COVID-19的理解,并指导新疗法的开发。
Verma总结说:“这项研究证明了大型生物库在公共卫生应对当前和未来流行病方面将遗传变异与电子病历数据联系起来的价值和影响。MVP是美国最多样化的群体之一。我们有一个独特的机会来扫描COVID-19大流行之前记录的数千种疾病。我们深入了解了COVID-19的基因结构风险因素以及疾病并发症。”
合著者Katherine Liao补充说:“对我们来说,最突出的一点是,大量免疫介导的疾病与COVID-19的严重表现具有相同的遗传结构。”“这些关联的本质揭示了SARS-CoV2病毒如何推动人类免疫系统的一个压力点,以及它如何在对抗感染的同时保持足够的控制,从而使它不会成为一个自身免疫过程,攻击自己。”