新数据库“刺激”癌症研究

由KAUST的科学家开发的交互式门户网站为癌症研究人员提供了一个平台，以询问基因非编码部分的RNA剪接如何促进不同类型肿瘤的生长。

这个名为SpUR (Splicing in untranslation Regions的缩写)的新资源可以在网上免费获得，详细介绍了在癌症中发现的1000多个剪接事件，这些剪接事件发生在mRNA的非编码区域，位于蛋白质编码停止信号的下游。这些事件的位点和表达水平在10种癌症类型和相应的正常组织的近8000个样本中进行了编目和可视化。

有了这个工具，独立的研究小组现在可以进一步探索个体剪接事件的作用癌症的发展和发展。“这些事件可能成为研究癌症中RNA失调的候选者学术研究人员计算生物科学研究中心代理副主任、科科大智能健康计划副主任高鑫说。“或者它们可以作为开发基于rna的抗癌药物的主要来源。”

计算机科学家高，与博士后张斌和研究工程师阿迪勒·萨利希一起，与新加坡癌症科学研究所的研究人员合作创建了SpUR数据库。

研究表明，基因下游序列的剪接(被称为3'非翻译区，或3' utr)在癌症中普遍存在，特别是在与肿瘤侵袭有关的基因中。因此，癌症中含有更多这些基因重组事件的患者往往有更差的生存结果。

作为原理证明，研究人员设计了一种被称为反义寡核苷酸(ASOs)的剪接开关剂，可以阻断3' utr中的这种剪接过程。当给药时肝癌细胞在美国，这些药物有助于抑制肿瘤生长。由于相同的剪接事件“在不同的基因中无处不在地表达”癌症Gao指出，这种类型的治疗策略“可能有助于发展广谱抗癌药物。"

一个潜在的目标是CTNNB1，这是一种为制造一种叫做-连环蛋白的蛋白质提供指令的基因。鉴于-连环蛋白在许多癌症信号传导途径中起着核心作用，制药公司长期以来一直试图将其作为目标，但收效甚微。Gao和他的合作者的研究表明，CTNNB1的3' UTR剪接广泛存在于肝癌、乳腺癌、结肠癌、肾癌、肺癌和其他器官的癌症中，剪接变体是肿瘤进展的主要驱动因素。

在小鼠肝脏模型中癌症阻断这种剪接导致肿瘤完全消退。因此，针对CTNNB1剪接的ASO疗法可能对患者有广泛的效用，正如Gao指出的那样，它不太可能是唯一的一种。

这项研究发表在自然细胞生物学。

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