大流行正在改变病毒菌株的遗传景观
![The epidemiology of RSV detections in three Australian states—New South Wales (NSW), Western Australia (WA), and Victoria (VIC). Laboratory testing for RSV in 2020 as weekly percent positive (red line, left y-axis) and as total number of tests performed (gray bars, right y-axis). In each panel, the dashed red line represents mean monthly RSV percent positive over the three previous seasons, and corresponding red shading represents minimum and maximum weekly percent positive. Pink-shaded bars across the top of each plot indicate the severity of pandemic restrictions, with darker colors indicative of greater stringency. Blue bars across the top of each plot indicate the periods during which students did not attend school either due to pandemic restrictions or school holiday periods, with darker colors indicative of more stringent school restrictions. Credit: <i>Nature Communications</i> (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-30485-3 大流行正在改变病毒菌株的遗传景观](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2022/the-pandemic-is-changi-3.jpg)
悉尼大学的一项LED研究揭示了大流行如何改变澳大利亚冬季病毒的正常模式,新的菌株出现了,并使大多数其他人“灭绝”。研究人员警告未来意外的篮板。
最早记录Covid-19对澳大利亚现有病毒影响的研究之一揭示了大流行是如何造成该国呼吸道合胞病毒(RSV)的发生率和遗传学的巨大变化的。
RSV是常见的病毒通常会导致轻度,寒冷的症状,感染可能是严重的,特别是对于婴儿和老年人。
研究人员说,大流行破坏了RSV的季节性模式,RSV是一组常规“冬季病毒”的主要成员。在2020年期间,由于1920年的旅行限制和感染控制措施,冬季RSV流行不足。
但是,RSV是Covid-19之后重新出现的首个关键呼吸道病原体之一。
出版于自然通讯,研究人员在2020 - 21年夏季在该国两岸进行了遗传测序(病毒的遗传指纹和映射的遗传指纹)。
爆发与COVID-19控制措施的缓解相吻合。
一个令人惊讶的发现是在Covid-19之前已经知道的RSV菌株中的一个重大“崩溃”,而新的RSV菌株的出现占主导地位爆发在西澳大利亚州,新南威尔士州和澳大利亚首都地区。
重要的是,研究人员随后追踪了每次疫情的病毒播种到维多利亚州,这导致了另一次重大的RSV爆发。
“我们的遗传研究表明,先前的大多数RSV菌株都“灭绝”,并且每次爆发只有一个遗传谱系幸存下来。”用于传染病,医学和健康学院的医学研究所。ob欧宝直播nba
“我们需要重新评估我们对包括流感在内的普通病毒的当前理解和期望,并改变我们如何管理它们的方法。”
这项研究还提出了重要的问题,即RSV的迅速传播和演变如何为包括流感在内的其他病毒的重新出现。
“流感菌株的星座循环前后,19也发生了很大变化,导致我们选择年度疫苗的成分和时机的挑战。往年。”伊甸博士说
目前没有RSV疫苗,但这是疫苗和治疗性开发的主要重点。
伊甸博士说:“我们需要保持警惕 - 某些病毒可能几乎消失了,但可能会在不久的将来,可能在不寻常的时期反弹,并产生更大的影响。”
“我们需要为在正常季节性时期之外的大规模RSV和我们的卫生系统做好准备。”
病毒景观处于变化状态
该研究记录了SARS-COV-2的出现后,RSV流行病学的重大转变,SARS-COV-2(导致Covid-19的病毒)。
与绘制在社区中绘制病毒扩散的接触示踪剂不同,研究人员在遗传水平上绘制了病毒的循环,被视为“遗传流行病学”。
研究人员对Covid-19大流行前后收集的数百种RSV阳性样品进行了遗传测序,并使用这些数据创建了遗传“家谱”,从而追踪了每个病毒菌株的谱系。
在COVID-19之前,两个主要的RSV亚型(A和B)以相似的水平共循环。
在2020年末至2021年初,在爆发期间,情况发生了巨大变化。发现RSV-A亚型是主要的菌株,在所有州的病例中,大于95%的病例。RSV-B几乎消失了。
伊甸博士说:“我们发现有两种新的RSV菌株,均为RSV-A子类型,它们的地理起源与众不同。”
“一个是对新南威尔士州,法案和维多利亚州的案件负责,另一个是对西澳的案件负责。”
伊甸博士说,Covid-19的大流行介绍了独特的情况,塑造了该病毒在澳大利亚的遗传景观,在全球范围内,对RSV的遗传多样性如何恢复产生了重要的后果。
作为进化过程的一部分,病毒自然会积累小的遗传变化,足以使其与众不同,但也可以追溯到与遗传家族树相似的病毒“父母”的变化。这些菌株在环境中共存,是导致遗传多样性的原因。
研究人员发现,RSV-A和RSV-B的遗传多样性极低,但随着国际边界继续开放,可能会恢复。
进一步探索