单细胞分析显示线索有前途的癌症治疗
![A functional landscape and activation states of CD19 CAR T preinfusion products from patients with ALL. (A) Schematic of experimental design. MSLN, mesothelin. (B) Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) plot of 97,981 single CAR T cells collected from 12 patients. Eleven clusters are identified through unsupervised clustering. (C) UMAP distribution of all profiled cells separated by stimulation conditions. (D) Clustering and differential expression analysis of single CAR T cells revealed three major populations, characterized respectively by high expression levels of HMGB2, LTB, and CSF2. The distribution of the three marker genes and the cell cycle expression pattern of four experimental conditions were shown. (E) Quantification of fully active CSF2<sup>+</sup> cell proportion in three response groups at the four conditions. Upon stimulation with CD19-3T3 cells or anti-CD3/CD28 beads, a large population of cells express high level of CSF2 and other cytokines, including IFNG, IL2, IL13, CCL3/CCL4, and XCL1/XCL2. The P values were calculated with Mann-Whitney test. Credit: <i>Science Advances</i> (2022). DOI: 10.1126/sciadv.abj2820 单细胞分析显示线索有前途的癌症治疗](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2022/single-cell-analysis-r-2.jpg)
一种癌症治疗被称为汽车T治疗已经显示出巨大的希望血液癌症治疗在过去的十年中,但通常,患者复发在很短的时间内。现在,一组研究人员发现了一些重要线索why-potentially导致治疗,防止复发。
这项研究中,研究人员之间的合作在耶鲁大学和宾夕法尼亚大学,发表在科学的进步。
汽车T治疗包括隔离病人的T细胞抵抗病毒的血液和基因修改他们嵌合抗原受体(汽车),目标表面标记表示癌症细胞。这些汽车T细胞注入到患者的循环癌症细胞。它已被证明特别有效的战斗血液癌症如急性淋巴细胞性白血病(ALL),淋巴瘤和多发性骨髓瘤。然而,缓解大量的科目是短暂的,和30%到60%的患者在一年内复发。
研究人员着手识别之间的差异长期缓解的病人和病人复发。他们寻找模式100000年病人的细胞,研究单一汽车从12儿科所有患者T细胞。这12个患者中,有5个完全缓解持续超过五年,另外五个复发过程中试验在平均时间9.6个月。其他两个科目没有显示客观反应治疗。
在实验室与技术发达的荣迷,耶鲁大学生物医学工程教授,耶鲁大学医学院的病理学研究人员使用所谓的“multi-omics”措施从转录组数据集,proteome-to执行一个强大的单细胞分析。这样做,他们能够仔细研究每一个细胞的整个基因表达谱和识别隐藏的分子机制车中T细胞,这可能在未来的发展有一个角色的治疗方法。
研究小组识别模块中的cytokines-secreted蛋白质,充当信使免疫系统,哪些是关键的监管机构编制的免疫细胞。其中,他们发现一群代表辅助T细胞因子2 (Th2)功能是细胞中知名度进入缓解期患者的五年或更多。Th2细胞亚型的细胞,调节免疫反应的激活和维护。,巴勃罗·g·卡马拉说,宾夕法尼亚大学的遗传学助理教授,“我们可以更好地评估不同的车从不同的患者T细胞的功能。”
“这观察意味着Th2函数可能是不可或缺的维持一个长期缓解汽车T疗法,”补充说这项研究的首席作者,倪志亮呗,风扇耶鲁大学实验室的博士后。
球迷说的分析提供了有价值的见解的因素确定为什么一些病人进入持续缓解。
”也表明潜在生物标志物预测治疗结果之前管理这昂贵和复杂的治疗在癌症患者,”他说。
![单细胞分析显示线索有前途的癌症治疗](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800/2022/single-cell-analysis-r-1.jpg)
研究人员扩大了49个额外的所有病人参加另外两个汽车T试验,进行独立评估。j·约瑟夫Melenhorst,该研究的作者之一、前宾夕法尼亚大学病理学和实验室医学教授,耶鲁大学和宾夕法尼亚大学集体验证实验结果表示,Th2 T汽车函数的存在注入产品确实是与长期缓解5年以上。
“大约10年随访,我们收集了足够的数据,现在能回答这紧迫的未满足的问题:与非常持久的反应相比,为什么这些患者复发吗?”他说。
基于当前的研究结果,研究人员已经扩大了单细胞multi-omics分析81例,覆盖在车里的所有临床反应类型T治疗。
“我们预计这个巨大的数据集可以为我们提供一个更精确的和全面的理解的基本机制,“球迷说。