在癌症样本中发现了13个与表观遗传变化相关的特殊基因
减轻个人和社会的癌症负担是全球关注的一个主要领域。根据挪威癌症登记处的数据，到2020年底，挪威有35515人新诊断出癌症，超过30万人已经被诊断患有癌症。发展关于癌症的起因和基本过程的知识是一个重要的公共卫生优先事项。
在挪威分子医学中心(NCMM)，研究人员已经调查了19种癌症类型，以确定调节异常DNA甲基化的潜在分子参与者，DNA甲基化是一种与基因表达调节相关的表观遗传修饰。他们观察到13种转录因子(TF)的表达与TFBSs附近的DNA甲基化水平之间的关联，这些转录因子是在TF结合位点与DNA结合以控制基因表达的特殊基因。这13种tf中的每一种都是根据它们与至少两种DNA甲基化水平变化的关联来选择的癌症．他们的研究结果发表在表观遗传学和染色质．
癌症样本中转录因子和DNA甲基化之间的联系
在人体在美国，为了我们的健康发育，我们的DNA发生了无数的遗传过程。其中一个过程被称为DNA甲基化，这是一种与DNA相关的机制基因表达调控．异常的基因表达模式与多种疾病有关，包括癌症。
“DNA甲基化是一种自然的过程与基因表达的控制有关。在正常情况下，你有特定的DNA甲基化模式，但这可能被癌细胞劫持，结果显示不同的(异常)模式，”研究人员Roza Berhanu Lemma博士解释说。
NCMM的研究员Roza Berhanu Lemma博士和她的同事一直在研究DNA甲基化模式和转录因子之间的相互作用基因表达在癌症样本中。
“异常的DNA甲基化模式经常被报道癌症患者．我们想要找出这种失调的机制是什么，并看看是否有转录因子参与调节这一过程，”Lemma解释说。
研究人员在癌症样本中发现了13个与DNA甲基化模式相关的特殊基因
Lemma和她的同事开发了一个计算框架，利用来自癌症基因组图谱的患者特定数据，以及来自的人类转录因子的DNA结合信息，对转录因子和DNA甲基化之间的关系进行统计分析UniBind这是他们开发的一个数据库。
他们发现了13种转录因子，它们的表达水平与DNA结合位点周围的DNA甲基化量相关。在这13个转录因子中，大多数都是“先驱因子”，这意味着它们具有一种特殊的能力，可以结合到DNA中无法进入和甲基化的区域。
该团队发现的潜力
该团队的发现有可能导致更好的癌症诊断和/或预后。
“我们发现了这些转录因子和转录因子结合位点附近的DNA甲基化模式之间的特殊属性。一种方法可能是利用受这些调控的DNA甲基化模式转录因子作为潜在的生物标志物，”Lemma解释道。
她说:“通过这种类型的研究，我们贡献了额外的知识，以便在未来我们有可能利用癌症独特的表观遗传特征来探索潜在治疗方法的可能性。”
本研究为特定基因参与子代一个重要表观遗传标记的改变提供了支持证据癌症．这些发现对于强调肿瘤行为、功能和特性的生物学方面是至关重要的。然而，未来的研究将有必要进一步了解这一过程是如何与基因调节网络的重新连接相关联的癌症细胞．
