引起伤寒的细菌对基本抗生素的抗药性越来越强，在过去30年里广泛传播
Salmonella enterica serovar Typhi flagellar stain. Credit: Wikipedia, CC BY-SA 4.0" width="800" height="443">
根据发表在《柳叶刀》上的一项研究，引起伤寒的细菌对一些对人类健康最重要的抗生素越来越有抗药性柳叶刀微生物日报》。对肠炎沙门氏菌血清型伤寒菌(S. typhi)进行的最大规模基因组分析还显示，自1990年以来，几乎全部起源于南亚的耐药菌株已传播到其他国家近200次。
伤寒是一个全球公共卫生问题，每年造成1100万人感染和10万多人死亡。虽然该病在南亚最为流行(占全球疾病负担的70%)，但它也对撒哈拉以南非洲、东南亚和大洋洲产生重大影响，突出表明需要采取全球应对措施。
抗生素可用于成功治疗伤寒感染，但其有效性受到耐药伤寒葡萄球菌菌株出现的威胁。到目前为止，对耐药伤寒杆菌的上升和传播的分析还很有限，大多数研究都是基于小样本。
这项新研究的作者进行了整体研究基因组对3489株伤寒链球菌分离株进行测序，这些分离株来自2014年至2019年从孟加拉国、印度、尼泊尔和巴基斯坦收集的伤寒确诊病例的血液样本。研究人员还对1905年至2018年间从70多个国家分离出的4169份伤寒沙门氏菌样本进行了测序并纳入分析。
利用遗传数据库鉴定了7658个测序基因组中的抗性赋能基因。菌株被分类为耐多药(MDR)，如果它们含有抵抗经典前线的基因抗生素氨苄西林、氯霉素和甲氧苄啶/磺胺甲恶唑。作者还追踪了对大环内酯类和喹诺酮类药物产生耐药性的基因的存在，这两种药物是对人类健康最重要的抗生素之一。
分析显示，自1990年以来，耐药伤寒杆菌菌株在国家之间至少传播了197次。虽然这些毒株最常发生在南亚以及从南亚到东南亚、东非和南部非洲，但在英国、美国和加拿大也有报道。
自2000年以来，耐多药伤寒链球菌在孟加拉国和印度稳步下降，在尼泊尔保持低水平(不到伤寒菌株的5%)，尽管在巴基斯坦略有上升。然而，它们正被对其他抗生素具有耐药性的菌株所取代。
例如，自1990年以来，对喹诺酮类药物产生耐药性的基因突变已经出现并传播了至少94次，几乎所有这些突变(97%)都起源于南亚。到21世纪初，喹诺酮耐药菌株占孟加拉国伤寒沙门氏菌的85%以上，到2010年，在印度、巴基斯坦和尼泊尔增加到95%以上。导致阿奇霉素(一种广泛使用的大环内酯类抗生素)耐药的突变在过去20年里至少出现了7次。在孟加拉国，含有这些突变的菌株在2013年左右出现，从那时起，它们的种群规模稳步增长。这些发现进一步证明了对第三代头孢菌素(另一类对人类健康至关重要的抗生素)耐药的伤寒沙门氏菌菌株迅速增加和传播。
该研究的第一作者、美国斯坦福大学的Jason Andrews博士说:“近年来，高度耐药的伤寒沙门氏菌株出现和传播的速度令人担忧，并强调迫切需要扩大预防措施，特别是在风险最大的国家。与此同时，伤寒链球菌耐药菌株已多次在国际上传播，这一事实也强调了将伤寒控制和抗生素耐药性更普遍地视为一个全球问题而不是局部问题的必要性。”
作者承认他们的研究存在一些局限性。在一些地区，特别是在伤寒流行的撒哈拉以南非洲和大洋洲的许多国家，伤寒沙门氏菌序列的代表性仍然不足。需要更多来自这些区域的序列来提高对传播时间和模式的理解。即使在抽样较好的国家，大多数分离株也来自少数监测点，可能不能代表流行菌株的分布。因为伤寒沙门氏菌的基因组只覆盖了所有基因组的一小部分伤寒病例，估计电阻-引起的突变和国际传播可能被低估了。这些潜在的低估凸显了扩大基因组监测的必要性，以提供一个更全面的窗口来了解耐抗生素生物的出现、扩张和传播。
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