新COVID变异可能是更强的传染性,但这并不意味着R0,或基本繁殖数量,增加了
在大流行期间我们都熟悉很多流行病学的概念。
在2020年初被介绍给我们的是“基本的生育数量,”或R0。这告诉我们的内在传染性病毒,或其固有的能力从一个人传播到另一个在一个特定的人口。
我们也了解了“有效的繁殖数量,雷夫。这告诉我们关于病毒的速度实际上是蔓延,人口。
随着BA.4/5的出现,已经有一些困惑在这些概念如何帮助我们理解为什么变体传播速度比另一个。
仅仅因为一个变异传播更快,它并不一定意味着R0更高。
R0实际上告诉我们什么?
R0告诉我们关于二级病例数从一个单一的人口在一个完全敏感。它描述了一种病原体的潜在的能力(如病毒)传播,pathogen-specific。
较高的病原体R0值有可能导致大流行。的祖先菌株SARS-CoV-2导致COVID(病毒),R0大约在3。
R0也是特定人群。这取决于人们的行为“基线”,在大流行。例如,一个人口稠密的城市有大量的室内场所人们混合可能为同一病原体R0高于人口稀疏的地区和群体之间的混合。
雷夫呢?
雷夫是平均新增感染人数由受感染的个人在公共卫生措施的存在,行为变化,人口免疫(从以前的感染和疫苗)。
因此雷夫会随着时间而改变。
这是一个关键指标一种流行病是否增加或减少。当雷夫高于1,疫情正在增长。如果控制措施,人口免疫力,或其他因素可以带来以下雷夫1,流行在下降。
在大流行,雷夫一直经常为澳大利亚和估计报道决策者。
新变种竞争现有怎么样?
COVID大流行可以分为几个不同的时代,每一个定义的出现了一个新的变种:
- 在2020年末α
- δ在2021年年中
- 在2021年底οBA.1
- 在2022年初οBA.2
- οBA.4 BA.5。
这些变异能够战胜并取代前一个。
如果我们观察到一个假想的“变种”人群蔓延的速度比“变体B,”我们说变体有“生长优势”变体B。
这种增长优势,如果持续下去,意味着变体将取代变体B作为新的主导变体在人群中蔓延。
一个变种具有生长优势,而不是本质上是更强的传染性。事实上,R0变体可能更高,低,或B一样的变体。
这是因为变异的生长优势,变体B相比,可能受的任意组合:
- 短的一代时间
- 增加内在遗传性(R0)
- 增加水平的“免疫逃避。”
每一个司机都有不同的对未来的流行轨迹的影响和影响的有效性控制措施。
一代时间短
短的一代时间意味着更短的时间,平均而言,之间一个人感染,然后感染另一个人。平均每个感染者带来的新感染人数是相同的两个变体,但这些感染发生更快变体a。这将导致一个更快速增长情况下的变体,甚至当R0是相同的。
内在的传播性
增加内在传播性是指情况R0的变异高于变种病毒b .多个不同的生理变化,如变化,增加受感染的传染性的人,可能驱动。
免疫逃避
免疫逃避指的一个变体是多么容易感染那些以前被感染,或接种疫苗。
变异与高水平的免疫逃避可以在高度免疫的人群中迅速传播,因为人群中显然有更多的人能被感染。但这并不意味着它们本质上更强的传染性。
事实上,他们甚至有可能降低R0,仍有增长的优势。
对雷夫
所有这三个机制会导致增长优势,但有不同的含义的雷夫变体相比变体B。
增加内在遗传性或免疫逃避会增加雷夫对变体相比,b变种。然而更短的一代时间会导致生长优势而不影响雷夫。如果变量只有一个较短的一代时间,它会传播更快通过人口比B变种。
这是如何在COVID大流行吗?
在COVID大流行,一些变异出现相当大的增长优势之前的变体:α,δ,οBA.1 BA.2,以及最近οBA.4 BA.5。
增长优势的原因之前的变异是由不同的因素。
α的增长优势祖先菌株估计是由于更高的内在传播性。科学家们估计基本的繁殖数量(R0)α是43 - 90%高于祖先的菌株。
当οBA.1迅速出现在2021年末在高度免疫人群(包括澳大利亚,大多数司法管辖区有注射第二针疫苗覆盖率达到85%以上合格组),科学家立即怀疑免疫逃避是发挥作用。
新兴的数据分析量化的相对贡献免疫逃避和内在的传播性,可以解释的快速传播。
最近,我们看到的迅速崛起οBA.4 BA.5全球。新兴证据建议免疫逃避再一次,可能导致一个重要因素传播优势BA.4和BA.5先前ο变体。
这意味着我们期望BA.4和BA.5迅速蔓延在澳大利亚,尽管我们非常高水平的疫苗接种覆盖率和很多以前的感染。
然而,R0可能没有改变。即使有相同的内在传播性,只要有更多的人口又敏感,是指同一R0最终将翻译更多的感染。
不是一个简单的计算
整个大流行,传染病流行病学家不得不仔细评估可用的数据来估计为什么一个新的变种生长优势。
其他人,包括一些科学家谈话,不幸的是简单地假定增长优势是由于增加内在的遗传性。
他们有做过乘以现有变种的R0快多少新变种估计蔓延。重复应用这种方法导致了一个膨胀R0 BA.4/5估计,类似于麻疹。
虽然这种方法是好的α,因为家庭的研究表明,变异传播更有效地在以前未暴露的人群,这是不合适的一次买卖出现了。
这些因素都COVID独有。例如,新流感变异主要是由于出现免疫逃避,推动增长优势,取代先前毒株。
BA.4/5 R0的是什么?
随着每一个新的变体的出现,任务已变得更具挑战性,因为人口的感染史(不管你以前被感染,当和多少次)使数据的解释越来越多的困难。
所以现在很难估算R0 BA.4/5。
当然高于α和三角洲的证据的效力指示值至少祖先的变体(3)的两倍。这将使它在6。
和很可能更高,因为οBA.1击败三角洲由于一个增加内在的传播性和免疫逃避。
我们还不完全理解为什么BA.2 BA.1取代,这两件事内在的传播性和免疫逃避潜在的贡献。但是我们知道免疫逃避足以解释观察到的生长优势BA.4/5 BA.2。
因此,我们当前的最佳估计为R0 BA.4/5是BA.2可能相似,但实际价值仍不确定。很可能在6 - 10的范围。
