一个更好的战胜致命的白血病路线图
急性髓系白血病或AML,是最常见的急性血液癌症在成年人和最难以治疗。俄勒冈健康与科学大学的科学家们发现了一个潜在的新目标,阻止它:一个基因,活跃时,预测更糟的生存机会。
发现是最新的产量也是OHSU骑士癌症研究所的击败AML项目综合分析白血病细胞的DNA和RNA的平台,他们的敏感或耐药,以及超过800人的医疗结果与来自全国各地的AML捐赠样本的努力。
“这是给我们一个更好的了解这种疾病,路线图”Jeff Tyner说博士论文的文章的第二作者描述的新发现癌症细胞。Tyner教授细胞,发展和癌症生物学也是OHSU医学院。第一作者丹•底硕士,是一种高级的计算生物学家在实验室香农McWeeney博士,文章的第二作者。McWeeney教授、生物信息学和计算生物学的划分也是OHSU医学院和骑士癌症研究所的首席数据官。底部和McWeeney共同的建模和分析工作。
所有的数据都可以通过在线访问和查询,交互式可视化平台,Vizome,这是由McWeeney集团。“我们有责任为我们的病人,确保发现,共享数据和工具开发广泛的加速新疗法的发展,“McWeeney说。
美国国家癌症研究所的基因数据共享与底部紧密合作,Tyner和McWeeney原始数据的发布恰逢本月发表在癌症细胞。
向上,每年有20000美国人被诊断为AML和11000年死于它。成年人的五年生存率是27%。新的靶向治疗药物方面有所欠缺的承诺,因为癌症如此迅速的发展获得耐药性,迫切需要更有效的疗法。
在新的分析,庞大的基因表达数据结合临床结果使研究人员能够集中精力在一个基因,称为PEAR1,是最靠谱的一个人是否将AML生存。在病人的整体存活率显著降低白血病细胞显示高PEAR1基因的活动。
“这相当于最好的预后签名我们,“Tyner说。结果当在独立的数据集进行测试,包括癌症基因组图谱和分子医学研究所芬兰。在数据集,PEAR1表达升高意味着从AML患者更有可能死得早。
但是研究人员还发现,PEAR1基因的特性表明它可以停止AML有针对性的药物。PEAR1基因编码一种蛋白质通常用于信号由血小板。这意味着药物可以阻止PEAR1信号而设计的。研究人员已经开发出PEAR1抗体,可用于对肿瘤细胞的直接抗癌药物。在抗体针对的初步研究中,研究者测量PEAR1表面蛋白表达肿瘤细胞AML患者样本,发现它强烈与PEAR1 RNA水平用于确定PEAR1表达式的存在意味着生存的几率较低。
富人击败AML数据集使研究人员能够解决的药物反应模式。针对白血病干细胞的细胞作为“无差别”,因为他们还没有成熟到一个细胞类型AML研究主要目标,基于这一想法,消除这些未分化的细胞肿瘤会导致崩溃。但还没有工作,因为可以播种复发更成熟的细胞。肿瘤细胞中存在不同的成熟状态,改变他们对抗癌药物的反应。例如,一些药物更有效的针对AML癌症与不成熟细胞状态,而其他药物更有效的针对AML癌症细胞在一个更成熟的状态。
新研究协作涉及90多名研究人员发现,肿瘤可以显示多个细胞成熟状态的特点,和大多数药物和药物的家庭与细胞功效显著相关。73这类药物的选择集群分为三类:一个更大的活动与血液干细胞和progenitor-like状态,用更少的功效与更多的分化的细胞类型;另一个显示了相反的模式,以最大的活动与更成熟的树突细胞样的和monocyte-like邦;和第三个集群显示低调活动这两种形态类型。
“我们需要开始使用这个细胞成熟状态信息以一种新的方式思考理性的药物组合,“Tyner说。“这可能是一个跳板快速设计新药的临床试验的组合。”
