肿瘤bulk-RNA序列可识别非完全病理应答者中进展高风险的患者

来自西班牙的研究人员在接受新辅助化疗免疫治疗的非完全病理应答患者的手术标本中发现了与疾病进展相关的免疫表达特征，这可能有助于这些高危患者的随访和治疗管理。这项研究于今天在维也纳举行的IASLC 2022年世界肺癌大会上公布。

病理反应被假定为新辅助化疗-免疫治疗患者生存的替代品。从这个意义上说，非完全病理反应(非cpr)患者存在较高的风险疾病进展与完全病理应答者(CPR)相比。

识别基因表达模式一组西班牙研究人员，由Marta Casarrubios，西班牙耶罗-塞戈维亚阿拉纳卫生研究所(IDIPHISA)，西班牙耶罗-马达达honda大学医院(Hospital Universitario Puerta de耶罗- majadahonda)领导，分析了非cpr患者的手术样本，并描述了进展者和非进展者之间的差异。

Casarrubios博士及其同事分析了36例可切除的IIIA期NSCLC患者的手术组织样本NADIM试验(NCT03081689)进行分析。肿瘤RNA使用肿瘤免疫反应面板进行测序，该面板针对395个与免疫过程相关的基因。使用DESeq2和基因集富集分析(GSEA)评估组间差异表达基因(DEGs)和途径富集分析。CIBERSORTx用于估计免疫细胞亚型的比例。将患者分为完全病理应答者(n=22)和非完全病理应答者(n=14)。非cpr患者根据其在诊断后34.2个月时病情是否进展进一步分为进展者(P, n=5)或非进展者(NP, n=9)。ROC曲线分析中似然比最高的值作为阈值，将每个患者的deg或免疫细胞亚群分为高组或低组。

研究人员报告，与CPR相比，非CPR患者中有22个基因上调，其中大多数与增殖有关(CDKN3、CCNB2、KIAA0101、MKI67、BUB1、CDK1、TOP2A、FOXM1、MELK、MAD2L1)，肿瘤标志物(CDKN2A、KRT5、BRCA1、TWIST1)，以及其他(MAGEA3、CEACAM1、CXCL8、TNFRSF18、G6PD、HMBS、DGAT2、ISG15)。进一步的GSEA分析显示，CPR患者中与抗原加工、TCR共表达和淋巴细胞浸润相关的通路上调。非cpr患者的增殖、肿瘤标志物、干扰素信号、家政和肿瘤抗原通路均上调。关于P和NP的差异，我们发现P患者中有10个基因表达差异上调:IFI6和OAS3，参与干扰素信号转导;AKT和KRT7为肿瘤标记物;BST2、ISG15和IFI27参与I型干扰素信号，CD8B、SDHA、HMBS和OAS1参与。非cpr患者治疗后样本中较高水平的IFI6 (p=0.010)、BST2 (p=0.010)、CD8B (p=0.019)、AKT (p=0.033)、OAS3 (p=0.010)和IFI27 (p=0.010)与较低的无进展生存期(PFS)相关。此外，较高水平的HMBS (p=0.018)和AKT (p=0.003)与较低的总生存率(OS)相关。

AKT高表达患者的进展风险较高(HR: 10.31;95%CI 1.2 ~ 88.8)和死亡(HR:50.6;95%可信区间3.77 - -680.5)。高AKT患者的中位PFS为12.3个月(95%CI 0-32.6)，而低AKT患者则未达到。P和NP患者在估计细胞比例上没有观察到差异。但活化比例较高树突细胞或中性粒细胞增加与低PFS (p=0.019, p=0.053)和OS (p=0.033, p=0.003)分别相关。

Casarrubios博士说:“心肺复苏术患者手术样本中上调的通路表明，对PD-1阻断的有效免疫反应已经完成。”“此外，我们已经在非cpr患者的手术标本中发现了与疾病进展相关的免疫表达特征，这可能有助于这些高危患者的随访和治疗管理。”