研究表明,所有COVID-19 SARS-CoV-2病毒混合感染包括多种变体
![Whole genome sequencing of 140 COVID samples from infected individuals between April 2020 and August 2021 show infection signatures consistent with the major strain at the time represented in different color partitions. Each horizontal line illustrates a sequenced sample, and lineage specific positions are shown vertically. Gray shaded boxes represent mixed allele frequencies observed in our samples. Interestingly, we observe samples that represent mixed allele frequencies during the transition between B.1.1.7 and B.1.617.2 (purple partition). From the paper: COVID-19 Infection and Transmission Includes Complex Sequence Diversity, PLOS Genetics, September 8, 2022. Credit: Ernest (Ricky) Chan 凯斯西储大学的研究人员表明,所有COVID-19 SARS-CoV-2病毒混合感染包括多种变体](https://scx1.b-cdn.net/csz/news/800a/2022/researchers-at-case-we.jpg)
凯斯西储大学的研究人员发现广泛的遗传变异在SARS-CoV-2病毒病毒感染的患者在360基因测序,显示所有个体感染包括多个变异的病毒。
研究人员指出,报告的病毒通常强调一个占主导地位的应变,从而导致漏报病毒遗传变异并能产生严重的后果在公共卫生规划和响应。
“我们的工作带来了关注传染病的复杂性往往简单化当只考虑最丰富的病毒感染,我们检查的重要性变化表明,历史上被认为是噪音,”欧内斯特·陈(Ricky)说,主任生物信息学计算生物学研究所核心与克利夫兰凯斯西储医学院的。“我们发现基因变异在低频SARS-CoV-2感染可以在以后新病毒的早期指标负责传输激增。”
纸”,COVID-19感染和传播包括复杂的序列多样性,“将发表在9月8日,2022年公共科学图书馆遗传学。
CWRU团队进行全基因组测序SARS-CoV-2病毒从东北俄亥俄和250例患者使用类似的数据从另一个110的感染病毒的完整基因序列提供了通过国际研究的合作者。
这些数据是在早期的开发时COVID-19流行然后δα变体变体的主要问题。这项工作表明,突变中发现οBA.1和BA.2已经存在至少一年时间ο相对较小的变化和它的许多迭代成为“变体的担忧。”Omicron and its own variants were central to a major COVID-19 resurgence last winter.
“集中在多数共识的病毒变种在全球研究社区转移注意力从遗传变异的不断演变,这可能大大加剧COVID-19大流行,”彼得·齐默尔曼说教授在医学院病理学系。“关注多数变异诊断是关键的第一步发展,治疗和疫苗,然而研究社区变化需要量化和报告,所以公共卫生界和公众更充分的准备,灵活应对不断变化的病毒。”
继续进行定义和跟踪病毒血统的出现在世界各地不断进化的SARS-CoV-2。由于时间关系,全球研究人员一直在依靠跟踪和报告相对占主导地位的变化。但是CWRU的研究人员指出,考虑到单一感染的多个变化中,是很重要的报告病毒基因序列的一个更完整的表示了解这些基因变化可以传播和潜在的病人与不同类别的条件,包括来自根除努力的逃避。