团队开发了识别未来可能影响快速抗原检测性能的SARS-CoV-2突变的方法
一个研究小组表明，商业上可获得的快速抗原检测可以检测出过去和现在的担忧变异，并确定了可能影响未来检测性能的潜在突变。随着SARS-CoV-2病毒的新变种继续出现，人们对快速抗原检测的性能提出了担忧。
该团队开发了一种方法来评估SARS-CoV-2的突变如何影响识别抗体用于快速抗原检测。因为大多数快速抗原检测都能检测到SARS-CoV-2核衣壳蛋白质研究小组直接测量了N蛋白的突变如何影响诊断抗体识别目标的能力。
美国国家生物医学成像和生物工程研究所(NIBIB)主任、美国国立卫生研究院RADx技术项目负责人布鲁斯·j·特隆伯格博士说:“快速抗原检测仍然是一种重要的COVID-19缓解工具，随着SARS-CoV-2病毒的继续进化，确保这些检测能够检测到它是至关重要的。”“考虑到新变体的无限循环，这项研究的数据在未来几年将是有用的。”
这项研究发表在细胞他使用了一种叫做深度突变扫描的方法，同时评估N蛋白中任何单个氨基酸的取代如何影响诊断抗体结合。研究人员建立了一个详尽的N种蛋白质变异库，其中包括近8000种单氨基酸替换——代表了所有可能突变的99.5%以上——并评估了它们与11种商用快速抗原测试中使用的17种不同诊断抗体的相互作用。快速抗原检测通常使用两种不同的诊断抗体来检测SARS-CoV-2病毒。
对于每一个评估的诊断抗体，研究人员记录了N蛋白的哪些突变影响抗体识别。根据这些信息，他们为每一种抗体创建了“逃避突变配置文件”，其中列出了N蛋白的特定突变，这些突变会影响抗体与目标抗体结合的能力。虽然有几种诊断抗体可以识别N蛋白的同一区域，但研究人员发现，每种抗体都有独特的逃逸突变谱。随着SARS-CoV-2病毒继续发生突变，这些数据可用于标记特定抗体，这些抗体的诊断性能可能需要重新评估。
亚特兰大埃默里大学生物化学系助理教授、第一篇研究报告的作者Filipp Frank博士说:“根据我们的发现，过去和现在令人担忧的SARS-CoV-2的主要变体都不包含N个蛋白质突变，这将影响当前快速抗原检测中使用的抗体的识别。”“此外，这些数据可以通过确定哪些诊断抗体应该配对来确定最大数量的潜在N个蛋白质变异，从而为测试设计提供信息。”
埃默里大学生物化学系教授、高级研究作者Eric Ortlund博士说:“准确和有效地识别受感染者仍然是减缓COVID-19的一个极其重要的策略，我们的研究提供了关于未来可能干扰检测的SARS-CoV-2突变的信息。”“这里概述的结果可以让我们快速适应病毒的新变种继续出现，代表着立即的临床和公共卫生影响。”
虽然许多担忧的变体包含N蛋白的多重突变，但研究作者指出，他们的方法并没有评估多重突变可能影响诊断性抗体识别，代表了本研究的局限性。
