人类基因组中的古老病毒残余在正常组织中很活跃

人类基因组中的古老病毒残余在正常组织中很活跃
人体中的HML-2 ORF转录本:这张人体地图(经允许改编自GTEx联盟网站)显示了每个样本组织中可能表达的人类内源性原病毒HML-2 ORF。蓝色代表Gag,绿色代表Pro,粉色代表Env,橙/紫分别代表Rec和Np9。方框表示从邻近或周围基因的转录中读取的表达或其他不确定的表达。三角形显示了LTR驱动的病毒ORF转录。这张图显示了HML-2病毒orf的广泛范围,可在全身非病变组织中转录。图片来源:Burn A等人,2022年,PLOS生物学,CC-BY 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)

根据美国波士顿塔夫茨大学的Aidan Burn及其同事10月18日发表在开放获取期刊上的一项研究,人类基因组中的古代病毒残余在健康组织和患病组织中都很活跃,限制了它们作为疾病生物标志物的效用公共科学图书馆生物学

精子或病毒感染会导致被永久地纳入人类内源性逆转录病毒(HERV)是一种古老病毒的遗传残余,约占病毒总数的8%.虽然不再具有传染性,一些HERV仍然包含完整的基因,并产生HERV RNA转录本与某些癌症有关。

然而,HERV在健康组织中的表达在很大程度上尚未被探索。为了解决这一知识缺口,研究人员使用来自基因型组织和表达项目的RNA序列数据来调查非患病组织中属于近期HERV亚群HML-2转录本的存在。该数据库包括从近1000个个体收集的54种不同组织类型的基因表达数据。作者在所有组织类型中检测到HML-2转录本,小脑、垂体、睾丸和甲状腺组织中水平升高。

结果表明,HML-2的活性并不局限于病变或癌变组织,这具有重要的临床意义。例如,使用HML-2表达作为癌症生物标志物或治疗的靶点,需要考虑非病变组织中的背景表达。更古老的HML-2病毒在人类组织中表现出最高的表达水平,这可能表明,含有完整蛋白质编码序列的较年轻、降解程度较低的HERV片段的活性可能被细胞抑制,以防止有害病毒蛋白质的产生,作者说。

资深作者John Coffin补充道:“我们发现几乎所有的情况都很正常在它们的RNA中表达大约36种内源性原病毒中的一种或另一种,这些原病毒是我们远祖广泛传播的逆转录病毒感染的残余。我们希望这一发现能为进一步研究这些元素在人类生物学和疾病中的作用提供基础。”


进一步探索

嵌入人类基因组中的古老病毒元素并非来自化石逆转录病毒

更多信息: 公共科学图书馆生物学(2022)。DOI: 10.1371 / journal.pbio.3001826
引用:人类基因组中的古老病毒残余在正常组织中活跃(2022,10月18日),2022年10月19日从//www.puressens.com/news/2022-10-ancient-viral-remnants-human-genome.html检索
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