原发ccRCC和邻近正常组织中生态系统的单细胞景观。gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba实验设计创建与Biorender.com和Adobe Illustrator。gydF4y2BabgydF4y2Ba综合分析来自26个RCC样本的scRNA-seq样本，使用普通UMAP包埋法可视化邻型(左)和肿瘤肾组织(右)。gydF4y2BacgydF4y2Ba显示主要细胞群标记表达的热图。gydF4y2BadgydF4y2Ba结合所有样品组分的所有腔室组成的变化，并在关节埋植上以细胞密度的形式显示出来。gydF4y2BaegydF4y2Ba肿瘤与邻近正常细胞密度差异的统计评估。采用双侧Wilcoxon检验，可视化为Z评分。红色表示肿瘤细胞丰度增加，蓝色表示肿瘤细胞丰度减少。gydF4y2BafgydF4y2Ba用成分数据分析评估细胞组成的变化。的gydF4y2BaxgydF4y2Ba-axis表示每种细胞类型的分离系数，阳性值对应肿瘤中丰度增加，阴性值对应肿瘤中丰度减少。箱线图和单个数据点显示了基于样本和单元格的自举重采样的不确定性(参见方法)。箱线图包括中心线:中位数;框限:上下四分位数;晶须最多延伸1.5×四分位数区间，超过上下四分位数。gydF4y2BaggydF4y2Ba箱形图显示了主要细胞群中原发性肾细胞癌和正常肾组织之间的转录变化的幅度。根据皮尔逊线性相关系数(Pearson linear correlation coefficient)评估震级，由原发性肾癌和正常肾脏组织的中等变异归一化(见方法)。在样本组(周细胞**gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.003;内皮* *gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.003;纤维母细胞* *gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.003;红色的* *gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.005;宏* *gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.004;增殖T细胞*gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.01;Treg * *gydF4y2BapgydF4y2Ba= 0.009)。箱线图包括中心线:中位数;框限:上下四分位数;晶须最多延伸1.5×四分位数区间，超过上下四分位数。gydF4y2BahgydF4y2BaMDS嵌入不同样本，基于他们的整体表达距离。相似度测量测量每个亚种群的表达变化的幅度，使用大小加权平均值将它们组合成控制组成差异的总体表达距离。形状表示不同的样品分数。信贷:gydF4y2Ba自然通讯gydF4y2Ba(2022)。DOI: 10.1038 / s41467 - 022 - 33375 - wgydF4y2Ba
在肾癌患者中，癌细胞中四种特定基因的活性似乎能够预测肿瘤扩散的风险和患者的生存机会。瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员在发表于gydF4y2Ba自然通讯gydF4y2Ba．gydF4y2Ba
“这有可能成为一种工具，在早期阶段更好地了解这种疾病的病程。然后，就可以更密切地监测肿瘤扩散可能性较高的患者，以便迅速发现和治疗肿瘤的任何生长gydF4y2Ba肿瘤gydF4y2Ba卡罗林斯卡学院妇女和儿童健康部门的高级研究员、该研究的最后一位作者尼尼布·巴尔亚诺说。gydF4y2Ba
透明细胞肾癌是成年人最常见的肾癌。如果肿瘤局限于肾脏，预后通常是良好的，但如果肿瘤扩散到骨骼(约三分之一的患者会发生这种情况)，5年生存率仅为10%左右。gydF4y2Ba
免疫疗法称为检查点抑制剂，近年来已成为透明细胞肾癌患者的重要治疗方法。但这是很常见的gydF4y2Ba癌症细胞gydF4y2Ba形成对治疗的耐药性，这可能部分归因于癌细胞周围环境的因素，即所谓的肿瘤微环境。gydF4y2Ba
在目前的研究中，研究人员检查了9名透明细胞肾癌患者的样本。这项研究是由卡罗林斯卡研究所的研究人员、招募患者的马萨诸塞州总医院的临床医生和来自美国波士顿哈佛医学院的计算科学家合作完成的。gydF4y2Ba
肿瘤组织和附近的正常肾脏组织都来自同一名患者，以便能够进行匹配比较并控制个体间的变异。细胞采用单细胞分析;测序技术使研究组织中的每一个细胞成为可能gydF4y2Ba基因表达gydF4y2Ba即在单个细胞中哪些基因是活跃的。gydF4y2Ba
在两名患者中，研究人员还比较了来自肾脏的原发肿瘤组织和来自骨骼转移瘤的组织。gydF4y2Ba
研究表明，一种遗传特征由四个组成gydF4y2Ba特定的基因gydF4y2Ba可以预测肿瘤是否会扩散到骨骼和能否存活。同时过表达这些基因(SAA1, SAA2, APOL1和MET)表明患者有更大的风险发展为肿瘤扩散和较差的生存结局。gydF4y2Ba
当研究人员在7名转移性透明细胞肾癌患者中检查骨转移瘤的肿瘤细胞时，也证实了基因特征与扩散风险的关联。gydF4y2Ba
此外，研究表明肿瘤的微环境对肿瘤的生长有抑制作用gydF4y2Ba免疫系统gydF4y2Ba研究人员提出了几个可能的药物靶点，可能值得进一步研究。这些都是通过计算机模拟细胞相互作用来确定的。gydF4y2Ba
研究人员说，这项研究提供了关于透明细胞肾癌中肿瘤细胞及其微环境之间相互作用的重要生物学知识。gydF4y2Ba
“我们希望我们的结果将有助于进一步研究影响肿瘤微环境的因素，最终可以提供治疗癌症复发和扩散的新方法。对我们来说，下一步是研究骨髓和骨骼转移瘤与肾脏局部肿瘤的区别，以及骨骼转移瘤肾癌患者的骨髓与健康骨髓的区别。我们希望它能帮助我们回答为什么免疫疗法对某些人不起作用的问题gydF4y2Ba肾癌gydF4y2Ba阿黛尔·阿尔查欣说，她是卡罗林斯卡学院妇女儿童健康系的博士生，也是该研究的第一作者之一。gydF4y2Ba
参与出版的KI研究人员表示，不存在潜在的利益冲突。其他作者与各种制药和生物技术公司有联系，形式包括创立和咨询承诺。更多信息请参见科学文章。gydF4y2Ba
更多信息:gydF4y2Ba透明细胞肾细胞癌的转录转移特征预测生存率，gydF4y2Ba
自然通讯gydF4y2Ba(2022)。gydF4y2Ba
DOI: 10.1038 / s41467 - 022 - 33375 - wgydF4y2Ba
引用gydF4y2Ba:基因特征指向肾癌预后(2022年，10月17日)检索于2022年10月17日//www.puressens.com/news/2022-10-gene-signature-prognosis-kidney-cancer.htmlgydF4y2Ba
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